23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1828 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1828  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  389  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.47902 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2147  hypothetical protein  51.96 
 
 		 198 aa  186  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4162  hypothetical protein  47.22 
 
 		 195 aa  131  7.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0836389  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8067  hypothetical protein  35.15 
 
 		 178 aa  95.5  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00850  hypothetical protein  36.1 
 
 		 186 aa  90.5  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00463032  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3247  integral membrane protein  32.77 
 
 		 168 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3236  integral membrane protein  32.2 
 
 		 168 aa  78.2  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.687326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3298  integral membrane protein  32.2 
 
 		 168 aa  78.2  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.172548  normal  0.0280313 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1394  integral membrane protein  33.89 
 
 		 170 aa  75.9  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.070776  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0322  hypothetical protein  33.17 
 
 		 192 aa  74.3  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.751848  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3501  integral membrane protein  33.1 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543403  normal  0.33628 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0595  putative integral membrane protein  32.96 
 
 		 167 aa  65.5  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00342772 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0997  hypothetical protein  34.71 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0832  integral membrane protein  35.66 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000357641  normal  0.309934 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37820  hypothetical protein  32.46 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.156933 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3005  integral membrane protein  29.06 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0295794 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3441  hypothetical protein  31.47 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00151639  normal  0.878549 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3103  hypothetical protein  31.72 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.531887  normal  0.721362 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0067  integral membrane protein  38.82 
 
 		 188 aa  49.3  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3626  integral membrane protein  40 
 
 		 171 aa  48.1  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3135  hypothetical protein  34.41 
 
 		 173 aa  47.4  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.675068  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3703  hypothetical protein  33.33 
 
 		 164 aa  46.2  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2049  putative tricarboxylic transporter, TctB (4TM)subunit  26.88 
 
 		 176 aa  41.2  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0136396  normal  0.392165 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>