17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3488 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3488  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  328  2e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.916647  normal  0.0908777 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2731  hypothetical protein  70.12 
 
 		 161 aa  223  9e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.340219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3122  hypothetical protein  63.8 
 
 		 162 aa  204  3e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.417087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3098  putative tricarboxylic transport membrane protein  34.9 
 
 		 155 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0902  putative tricarboxylic transport membrane protein  34.9 
 
 		 155 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0936  putative tricarboxylic transport membrane protein  34.9 
 
 		 155 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.271067 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0926  putative tricarboxylic transport membrane protein  34.9 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0874  putative tricarboxylic transport membrane protein  34.9 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3434  putative tricarboxylic transport membrane protein  34.9 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.63141  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1872  putative tricarboxylic transport TctB  30.86 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0632285 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2191  membrane protein  34.15 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02415  hypothetical protein  31.17 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0949  hypothetical protein  32.1 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003383  putative tricarboxylic transport TctB  31.61 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2049  putative tricarboxylic transporter, TctB (4TM)subunit  25.3 
 
 		 176 aa  47.8  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0136396  normal  0.392165 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3501  integral membrane protein  23.53 
 
 		 166 aa  41.2  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543403  normal  0.33628 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3298  hypothetical protein  28.57 
 
 		 150 aa  40.8  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.667523  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>