14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0926 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_3434  putative tricarboxylic transport membrane protein  100 
 
 		 155 aa  297  3e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.63141  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0926  putative tricarboxylic transport membrane protein  100 
 
 		 155 aa  297  3e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3098  putative tricarboxylic transport membrane protein  99.35 
 
 		 155 aa  296  8e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0902  putative tricarboxylic transport membrane protein  99.35 
 
 		 155 aa  296  8e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0936  putative tricarboxylic transport membrane protein  99.35 
 
 		 155 aa  296  8e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.271067 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0874  putative tricarboxylic transport membrane protein  98.06 
 
 		 155 aa  291  3e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003383  putative tricarboxylic transport TctB  42.58 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02415  hypothetical protein  40.65 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0949  hypothetical protein  40.13 
 
 		 165 aa  94  7e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1872  putative tricarboxylic transport TctB  39.87 
 
 		 159 aa  92  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0632285 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2191  membrane protein  39.22 
 
 		 166 aa  90.5  9e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3488  hypothetical protein  34.9 
 
 		 163 aa  76.3  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.916647  normal  0.0908777 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3122  hypothetical protein  31.76 
 
 		 162 aa  57  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.417087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2731  hypothetical protein  30.65 
 
 		 161 aa  47  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.340219  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>