16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2731 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2731  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  311  2.9999999999999996e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.340219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3122  hypothetical protein  70.81 
 
 		 162 aa  224  5.0000000000000005e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.417087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3488  hypothetical protein  70.12 
 
 		 163 aa  223  8e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.916647  normal  0.0908777 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1872  putative tricarboxylic transport TctB  29.45 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0632285 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3098  putative tricarboxylic transport membrane protein  30.65 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3434  putative tricarboxylic transport membrane protein  30.65 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.63141  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0902  putative tricarboxylic transport membrane protein  30.65 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0936  putative tricarboxylic transport membrane protein  30.65 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.271067 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0926  putative tricarboxylic transport membrane protein  30.65 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0874  putative tricarboxylic transport membrane protein  29.37 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1454  putative tricarboxylic transport membrane protein  29.63 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3236  integral membrane protein  32.74 
 
 		 168 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.687326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3298  integral membrane protein  32.74 
 
 		 168 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.172548  normal  0.0280313 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3247  integral membrane protein  32.74 
 
 		 168 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02415  hypothetical protein  31.54 
 
 		 164 aa  42.4  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3501  integral membrane protein  28.57 
 
 		 166 aa  41.2  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543403  normal  0.33628 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>