33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1454 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1454  putative tricarboxylic transport membrane protein  100 
 
 		 151 aa  295  1e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2896  putative tricarboxylic transport membrane protein  64.63 
 
 		 148 aa  155  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1800  hypothetical protein  50.39 
 
 		 146 aa  144  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.490656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3855  putative tricarboxylic transport membrane protein  49.3 
 
 		 150 aa  124  6e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.760581  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0733  hypothetical protein  43.17 
 
 		 143 aa  100  6e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.59707  decreased coverage  0.00107456 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4434  putative tricarboxylic transport membrane protein  33.81 
 
 		 146 aa  85.9  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0725  putative tricarboxylic transport membrane protein  41.26 
 
 		 149 aa  75.9  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54550  hypothetical protein  30.32 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000543729  normal  0.0724401 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2823  putative tricarboxylic transport membrane protein  39.64 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0616705 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3785  putative tricarboxylic transport membrane protein  31.82 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4767  hypothetical protein  32.61 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.433731  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0903  putative tricarboxylic transport membrane protein  30.22 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.530268  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1352  membrane protein TctB, putative  30.58 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3967  membrane protein TctB, putative  27.33 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.605379  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4233  membrane protein TctB, putative  28.48 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49470  tripartite tricarboxylate transporter small hypothetical protein  33.79 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0240129  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2899  tricarboxylic transport  29.58 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2931  tricarboxylic transport  29.58 
 
 		 143 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.331411  normal  0.167192 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3441  hypothetical protein  30.88 
 
 		 163 aa  50.4  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00151639  normal  0.878549 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2983  tricarboxylic transport  29.58 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.545092 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2966  tricarboxylic transport  29.58 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00298616 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3086  tricarboxylic transport  29.58 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2582  hypothetical protein  25.87 
 
 		 142 aa  48.9  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.909963  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1362  tricarboxylic transport  32.89 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0155  TctB protein  27.66 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2731  hypothetical protein  29.63 
 
 		 161 aa  45.4  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.340219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1826  membrane protein TctB, putative  26.72 
 
 		 167 aa  45.1  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4304  hypothetical protein  27.33 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.836999  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1417  tricarboxylate transport protein TctB, putative  27.27 
 
 		 161 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.342625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3343  tricarboxylic transport  28.97 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.363295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1456  hypothetical protein  30.17 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0874  putative tricarboxylic transport membrane protein  32.67 
 
 		 155 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0067  integral membrane protein  41.67 
 
 		 188 aa  40.4  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.841697 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>