37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1800 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1800  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  283  5e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.490656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1454  putative tricarboxylic transport membrane protein  51.43 
 
 		 151 aa  155  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2896  putative tricarboxylic transport membrane protein  51.41 
 
 		 148 aa  123  7e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3855  putative tricarboxylic transport membrane protein  43.48 
 
 		 150 aa  106  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.760581  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0733  hypothetical protein  35.71 
 
 		 143 aa  95.5  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.59707  decreased coverage  0.00107456 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4434  putative tricarboxylic transport membrane protein  34.27 
 
 		 146 aa  85.5  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4767  hypothetical protein  30.87 
 
 		 156 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.433731  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54550  hypothetical protein  30.67 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000543729  normal  0.0724401 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3967  membrane protein TctB, putative  27.4 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.605379  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49470  tripartite tricarboxylate transporter small hypothetical protein  30.34 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0240129  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0155  TctB protein  30.56 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0725  putative tricarboxylic transport membrane protein  32.61 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1352  membrane protein TctB, putative  29.91 
 
 		 152 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3010  hypothetical protein  28.39 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.238808  normal  0.526573 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2823  putative tricarboxylic transport membrane protein  31.82 
 
 		 143 aa  57  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0616705 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3785  putative tricarboxylic transport membrane protein  28.03 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0903  putative tricarboxylic transport membrane protein  26.95 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.530268  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4233  membrane protein TctB, putative  25.34 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3086  tricarboxylic transport  27.14 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2899  tricarboxylic transport  27.14 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2966  tricarboxylic transport  27.14 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00298616 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2983  tricarboxylic transport  27.14 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.545092 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2931  tricarboxylic transport  27.66 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.331411  normal  0.167192 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4304  hypothetical protein  29.05 
 
 		 152 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.836999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4540  hypothetical protein  29.03 
 
 		 156 aa  51.2  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1362  tricarboxylic transport  27.97 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1417  tricarboxylate transport protein TctB, putative  31.03 
 
 		 161 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.342625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1057  tricarboxylate transport protein TctB  30.77 
 
 		 152 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4394  tricarboxylate transport protein TctB  31.03 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837927 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2582  hypothetical protein  26.39 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.909963  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3343  tricarboxylic transport  25 
 
 		 143 aa  45.1  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.363295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5725  hypothetical protein  33.33 
 
 		 180 aa  43.9  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0156863  normal  0.729962 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1637  TctB protein  21.77 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3967  hypothetical protein  29.94 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1826  membrane protein TctB, putative  24.83 
 
 		 167 aa  42  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1456  hypothetical protein  29.47 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3501  integral membrane protein  26.06 
 
 		 166 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543403  normal  0.33628 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>