38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4233 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4233  membrane protein TctB, putative  100 
 
 		 152 aa  291  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3967  membrane protein TctB, putative  91.45 
 
 		 152 aa  275  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.605379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1352  membrane protein TctB, putative  79.61 
 
 		 152 aa  225  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4304  hypothetical protein  71.05 
 
 		 152 aa  197  5e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.836999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1057  tricarboxylate transport protein TctB  72.37 
 
 		 152 aa  186  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1417  tricarboxylate transport protein TctB, putative  71.05 
 
 		 161 aa  184  4e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.342625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4394  tricarboxylate transport protein TctB  70.39 
 
 		 152 aa  183  6e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837927 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54550  hypothetical protein  61.9 
 
 		 156 aa  176  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000543729  normal  0.0724401 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4767  hypothetical protein  61.9 
 
 		 156 aa  176  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.433731  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49470  tripartite tricarboxylate transporter small hypothetical protein  57.62 
 
 		 152 aa  145  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0240129  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1826  membrane protein TctB, putative  37.16 
 
 		 167 aa  97.8  5e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1456  hypothetical protein  42.74 
 
 		 147 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0155  TctB protein  42.66 
 
 		 147 aa  91.7  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1362  tricarboxylic transport  39.16 
 
 		 142 aa  81.6  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4434  putative tricarboxylic transport membrane protein  30.61 
 
 		 146 aa  80.5  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2899  tricarboxylic transport  37.93 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2582  hypothetical protein  32.39 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.909963  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3086  tricarboxylic transport  38.03 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2966  tricarboxylic transport  38.03 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00298616 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2983  tricarboxylic transport  38.03 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.545092 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2931  tricarboxylic transport  37.32 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.331411  normal  0.167192 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0733  hypothetical protein  35.66 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.59707  decreased coverage  0.00107456 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3343  tricarboxylic transport  34.27 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.363295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0903  putative tricarboxylic transport membrane protein  25.83 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.530268  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0725  putative tricarboxylic transport membrane protein  36.62 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1637  TctB protein  30 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1454  putative tricarboxylic transport membrane protein  28.48 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3855  putative tricarboxylic transport membrane protein  30.16 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.760581  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8067  hypothetical protein  32.03 
 
 		 178 aa  47.4  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1800  hypothetical protein  23.13 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.490656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0832  integral membrane protein  31.11 
 
 		 172 aa  44.3  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000357641  normal  0.309934 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3236  integral membrane protein  25.2 
 
 		 168 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.687326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3298  integral membrane protein  25.2 
 
 		 168 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.172548  normal  0.0280313 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2823  putative tricarboxylic transport membrane protein  30 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0616705 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3247  integral membrane protein  25.2 
 
 		 168 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3785  putative tricarboxylic transport membrane protein  33.57 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2074  hypothetical protein  31.87 
 
 		 169 aa  40.4  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3501  integral membrane protein  30.65 
 
 		 166 aa  40.4  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543403  normal  0.33628 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>