44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0903 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0903  putative tricarboxylic transport membrane protein  100 
 
 		 147 aa  280  4.0000000000000003e-75  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.530268  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0733  hypothetical protein  34.27 
 
 		 143 aa  80.1  0.000000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.59707  decreased coverage  0.00107456 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4434  putative tricarboxylic transport membrane protein  30.56 
 
 		 146 aa  77  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3086  tricarboxylic transport  29.37 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2899  tricarboxylic transport  29.37 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2931  tricarboxylic transport  29.37 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.331411  normal  0.167192 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2966  tricarboxylic transport  29.37 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00298616 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0725  putative tricarboxylic transport membrane protein  33.79 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2983  tricarboxylic transport  29.37 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.545092 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54550  hypothetical protein  28.77 
 
 		 156 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000543729  normal  0.0724401 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4767  hypothetical protein  27.4 
 
 		 156 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.433731  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1454  putative tricarboxylic transport membrane protein  30 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1637  TctB protein  31.25 
 
 		 145 aa  67  0.00000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3967  membrane protein TctB, putative  27.15 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.605379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1826  membrane protein TctB, putative  31.47 
 
 		 167 aa  65.5  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3343  tricarboxylic transport  32.87 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.363295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1352  membrane protein TctB, putative  26.36 
 
 		 152 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0155  TctB protein  31.97 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4304  hypothetical protein  26.49 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.836999  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2582  hypothetical protein  26.76 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.909963  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4233  membrane protein TctB, putative  25.83 
 
 		 152 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1362  tricarboxylic transport  30.07 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1417  tricarboxylate transport protein TctB, putative  26.72 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.342625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1800  hypothetical protein  25.95 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.490656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4394  tricarboxylate transport protein TctB  25.76 
 
 		 152 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837927 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49470  tripartite tricarboxylate transporter small hypothetical protein  25 
 
 		 152 aa  57  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0240129  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3855  putative tricarboxylic transport membrane protein  28.69 
 
 		 150 aa  57  0.00000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.760581  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1057  tricarboxylate transport protein TctB  25.19 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6111  hypothetical protein  27.14 
 
 		 164 aa  53.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1456  hypothetical protein  28.23 
 
 		 147 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3335  hypothetical protein  25.53 
 
 		 163 aa  51.6  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.122468 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3635  hypothetical protein  25.17 
 
 		 163 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0307  putative tricarboxylic transport membrane protein  25 
 
 		 164 aa  49.7  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8067  hypothetical protein  26.62 
 
 		 178 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4256  putative tricarboxylic transport membrane protein  27.43 
 
 		 163 aa  44.7  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.313811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3785  putative tricarboxylic transport membrane protein  27.94 
 
 		 144 aa  43.5  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3967  hypothetical protein  27.7 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2823  putative tricarboxylic transport membrane protein  28.69 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0616705 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37820  hypothetical protein  24.32 
 
 		 186 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.156933 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3501  integral membrane protein  25 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543403  normal  0.33628 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2222  putative tricarboxylic transporter, TctB (4TM)subunit  23.03 
 
 		 172 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0953872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2440  hypothetical protein  20.55 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0482298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3010  hypothetical protein  22.73 
 
 		 157 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.238808  normal  0.526573 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3918  putative tricarboxylic transport membrane protein  21.37 
 
 		 165 aa  40.8  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0635614  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>