38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4434 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4434  putative tricarboxylic transport membrane protein  100 
 
 		 146 aa  288  2e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1454  putative tricarboxylic transport membrane protein  33.81 
 
 		 151 aa  85.9  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4767  hypothetical protein  31.97 
 
 		 156 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.433731  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54550  hypothetical protein  30.82 
 
 		 156 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000543729  normal  0.0724401 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0733  hypothetical protein  31.47 
 
 		 143 aa  82.8  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.59707  decreased coverage  0.00107456 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3967  membrane protein TctB, putative  30.61 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.605379  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4233  membrane protein TctB, putative  30.61 
 
 		 152 aa  79.3  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1800  hypothetical protein  32.33 
 
 		 146 aa  75.1  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.490656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0725  putative tricarboxylic transport membrane protein  35.04 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49470  tripartite tricarboxylate transporter small hypothetical protein  32.21 
 
 		 152 aa  74.3  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0240129  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4304  hypothetical protein  30.61 
 
 		 152 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.836999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1352  membrane protein TctB, putative  31.29 
 
 		 152 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2896  putative tricarboxylic transport membrane protein  36.43 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1826  membrane protein TctB, putative  27.7 
 
 		 167 aa  72  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0155  TctB protein  30.82 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0903  putative tricarboxylic transport membrane protein  30.56 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.530268  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3855  putative tricarboxylic transport membrane protein  34.15 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.760581  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2899  tricarboxylic transport  32.64 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1637  TctB protein  30.56 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3086  tricarboxylic transport  32.62 
 
 		 143 aa  67  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2983  tricarboxylic transport  32.62 
 
 		 143 aa  67  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.545092 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2966  tricarboxylic transport  32.62 
 
 		 143 aa  67  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00298616 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2931  tricarboxylic transport  32.62 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.331411  normal  0.167192 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1456  hypothetical protein  29.51 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4394  tricarboxylate transport protein TctB  30.61 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837927 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1057  tricarboxylate transport protein TctB  31.29 
 
 		 152 aa  62  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1417  tricarboxylate transport protein TctB, putative  29.93 
 
 		 161 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.342625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2823  putative tricarboxylic transport membrane protein  34.15 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0616705 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2582  hypothetical protein  27.14 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.909963  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1362  tricarboxylic transport  29.58 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3335  hypothetical protein  30.22 
 
 		 163 aa  50.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.122468 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3635  hypothetical protein  29.5 
 
 		 163 aa  50.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3343  tricarboxylic transport  31.94 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.363295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6111  hypothetical protein  28.26 
 
 		 164 aa  47.4  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0307  putative tricarboxylic transport membrane protein  25.87 
 
 		 164 aa  41.6  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5906  putative tricarboxylic transport membrane protein  25.71 
 
 		 160 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.896471  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1419  TRAP-T family transporter small inner membrane subunit  27.64 
 
 		 163 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.218634  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3785  putative tricarboxylic transport membrane protein  29.55 
 
 		 144 aa  40.8  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>