30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3343 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3343  tricarboxylic transport  100 
 
 		 143 aa  280  5.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.363295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2931  tricarboxylic transport  69.23 
 
 		 143 aa  190  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.331411  normal  0.167192 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2983  tricarboxylic transport  69.23 
 
 		 143 aa  189  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.545092 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2966  tricarboxylic transport  69.23 
 
 		 143 aa  189  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00298616 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3086  tricarboxylic transport  69.23 
 
 		 143 aa  189  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2899  tricarboxylic transport  69.23 
 
 		 144 aa  189  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1362  tricarboxylic transport  66.9 
 
 		 142 aa  174  4e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2582  hypothetical protein  62.41 
 
 		 142 aa  167  7e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.909963  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0155  TctB protein  44.76 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1637  TctB protein  41.13 
 
 		 145 aa  95.5  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54550  hypothetical protein  38.19 
 
 		 156 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000543729  normal  0.0724401 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4767  hypothetical protein  36.81 
 
 		 156 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.433731  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1826  membrane protein TctB, putative  37.32 
 
 		 167 aa  88.2  4e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3967  membrane protein TctB, putative  37.32 
 
 		 152 aa  87  9e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.605379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1456  hypothetical protein  41.46 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0903  putative tricarboxylic transport membrane protein  32.87 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.530268  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4233  membrane protein TctB, putative  34.97 
 
 		 152 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1352  membrane protein TctB, putative  34.97 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4304  hypothetical protein  35.66 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.836999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4434  putative tricarboxylic transport membrane protein  31.25 
 
 		 146 aa  63.5  0.0000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49470  tripartite tricarboxylate transporter small hypothetical protein  36.36 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0240129  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1417  tricarboxylate transport protein TctB, putative  35.92 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.342625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4394  tricarboxylate transport protein TctB  34.51 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837927 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1057  tricarboxylate transport protein TctB  33.8 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0725  putative tricarboxylic transport membrane protein  35 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0733  hypothetical protein  30.22 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.59707  decreased coverage  0.00107456 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1454  putative tricarboxylic transport membrane protein  29.17 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1800  hypothetical protein  22.96 
 
 		 146 aa  46.2  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.490656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2823  putative tricarboxylic transport membrane protein  35.34 
 
 		 143 aa  44.3  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0616705 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2896  putative tricarboxylic transport membrane protein  37.27 
 
 		 148 aa  40.8  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>