30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_54550 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_54550  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  299  8.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000543729  normal  0.0724401 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4767  hypothetical protein  92.31 
 
 		 156 aa  280  6.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.433731  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3967  membrane protein TctB, putative  62.59 
 
 		 152 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.605379  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4233  membrane protein TctB, putative  61.9 
 
 		 152 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1352  membrane protein TctB, putative  62.42 
 
 		 152 aa  166  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4304  hypothetical protein  60.54 
 
 		 152 aa  147  6e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.836999  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1417  tricarboxylate transport protein TctB, putative  60.54 
 
 		 161 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.342625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1057  tricarboxylate transport protein TctB  59.18 
 
 		 152 aa  134  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4394  tricarboxylate transport protein TctB  58.5 
 
 		 152 aa  130  6e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837927 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49470  tripartite tricarboxylate transporter small hypothetical protein  55.48 
 
 		 152 aa  123  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0240129  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1456  hypothetical protein  48.03 
 
 		 147 aa  105  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1826  membrane protein TctB, putative  39.31 
 
 		 167 aa  96.7  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2899  tricarboxylic transport  40.85 
 
 		 144 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2966  tricarboxylic transport  40.85 
 
 		 143 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00298616 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2983  tricarboxylic transport  40.85 
 
 		 143 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.545092 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3086  tricarboxylic transport  40.85 
 
 		 143 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2931  tricarboxylic transport  40.14 
 
 		 143 aa  87.8  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.331411  normal  0.167192 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1362  tricarboxylic transport  38.89 
 
 		 142 aa  85.1  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4434  putative tricarboxylic transport membrane protein  30.82 
 
 		 146 aa  85.1  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2582  hypothetical protein  37.24 
 
 		 142 aa  80.5  0.000000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.909963  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3343  tricarboxylic transport  35.42 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.363295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0903  putative tricarboxylic transport membrane protein  28.77 
 
 		 147 aa  70.1  0.00000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.530268  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0733  hypothetical protein  34.03 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.59707  decreased coverage  0.00107456 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1637  TctB protein  32.19 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0155  TctB protein  34.64 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1454  putative tricarboxylic transport membrane protein  30.32 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0725  putative tricarboxylic transport membrane protein  38.28 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1800  hypothetical protein  28.47 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.490656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3855  putative tricarboxylic transport membrane protein  25.78 
 
 		 150 aa  43.9  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.760581  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2823  putative tricarboxylic transport membrane protein  34.68 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0616705 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>