33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3855 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3855  putative tricarboxylic transport membrane protein  100 
 
 		 150 aa  291  1e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.760581  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1454  putative tricarboxylic transport membrane protein  49.3 
 
 		 151 aa  137  6e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1800  hypothetical protein  42.97 
 
 		 146 aa  114  6e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.490656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2896  putative tricarboxylic transport membrane protein  47.55 
 
 		 148 aa  95.5  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0733  hypothetical protein  39.13 
 
 		 143 aa  89.4  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.59707  decreased coverage  0.00107456 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4434  putative tricarboxylic transport membrane protein  34.78 
 
 		 146 aa  77  0.00000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0903  putative tricarboxylic transport membrane protein  28.37 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.530268  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3967  membrane protein TctB, putative  30.34 
 
 		 152 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.605379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2823  putative tricarboxylic transport membrane protein  35.54 
 
 		 143 aa  50.1  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0616705 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4233  membrane protein TctB, putative  28.97 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1456  hypothetical protein  34.04 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1352  membrane protein TctB, putative  30.47 
 
 		 152 aa  47  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3086  tricarboxylic transport  29.08 
 
 		 143 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2899  tricarboxylic transport  29.08 
 
 		 144 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2966  tricarboxylic transport  29.08 
 
 		 143 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00298616 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2983  tricarboxylic transport  29.08 
 
 		 143 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.545092 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2931  tricarboxylic transport  29.08 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.331411  normal  0.167192 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54550  hypothetical protein  24.48 
 
 		 156 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000543729  normal  0.0724401 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3488  hypothetical protein  27.34 
 
 		 163 aa  44.3  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.916647  normal  0.0908777 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4767  hypothetical protein  23.78 
 
 		 156 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.433731  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2731  hypothetical protein  29.5 
 
 		 161 aa  44.3  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.340219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1362  tricarboxylic transport  34 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0874  putative tricarboxylic transport membrane protein  32.79 
 
 		 155 aa  43.5  0.0009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3785  putative tricarboxylic transport membrane protein  26.87 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0902  putative tricarboxylic transport membrane protein  32.79 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0936  putative tricarboxylic transport membrane protein  32.79 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.271067 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3098  putative tricarboxylic transport membrane protein  32.79 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3434  putative tricarboxylic transport membrane protein  31.97 
 
 		 155 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.63141  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0926  putative tricarboxylic transport membrane protein  31.97 
 
 		 155 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3635  hypothetical protein  28.67 
 
 		 163 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3967  hypothetical protein  25 
 
 		 163 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0725  putative tricarboxylic transport membrane protein  30.71 
 
 		 149 aa  40.8  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2440  hypothetical protein  29.25 
 
 		 152 aa  40  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0482298  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>