39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_49470 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_49470  tripartite tricarboxylate transporter small hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  282  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0240129  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4233  membrane protein TctB, putative  57.62 
 
 		 152 aa  158  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3967  membrane protein TctB, putative  54.3 
 
 		 152 aa  157  6e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.605379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1352  membrane protein TctB, putative  53.64 
 
 		 152 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54550  hypothetical protein  55.48 
 
 		 156 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000543729  normal  0.0724401 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4767  hypothetical protein  56.16 
 
 		 156 aa  136  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.433731  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4304  hypothetical protein  51.66 
 
 		 152 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.836999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1057  tricarboxylate transport protein TctB  53.64 
 
 		 152 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4394  tricarboxylate transport protein TctB  52.32 
 
 		 152 aa  121  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837927 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1417  tricarboxylate transport protein TctB, putative  50.99 
 
 		 161 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.342625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0155  TctB protein  43.36 
 
 		 147 aa  87.4  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1826  membrane protein TctB, putative  37.33 
 
 		 167 aa  84.7  4e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4434  putative tricarboxylic transport membrane protein  32.21 
 
 		 146 aa  80.1  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1456  hypothetical protein  42.62 
 
 		 147 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2931  tricarboxylic transport  38.89 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.331411  normal  0.167192 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2899  tricarboxylic transport  38.51 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1362  tricarboxylic transport  36.36 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3086  tricarboxylic transport  38.62 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2983  tricarboxylic transport  38.62 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.545092 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2966  tricarboxylic transport  38.62 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00298616 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2582  hypothetical protein  32.87 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.909963  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0903  putative tricarboxylic transport membrane protein  24.66 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.530268  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3343  tricarboxylic transport  32.87 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.363295  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0733  hypothetical protein  33.59 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.59707  decreased coverage  0.00107456 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1454  putative tricarboxylic transport membrane protein  33.79 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1800  hypothetical protein  28.15 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.490656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1637  TctB protein  29.53 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2074  hypothetical protein  33.33 
 
 		 169 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0725  putative tricarboxylic transport membrane protein  40.83 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2823  putative tricarboxylic transport membrane protein  33.07 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0616705 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0072  hypothetical protein  36.13 
 
 		 157 aa  46.2  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0377393  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3298  integral membrane protein  29.92 
 
 		 168 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.172548  normal  0.0280313 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3236  integral membrane protein  29.92 
 
 		 168 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.687326  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3441  hypothetical protein  36.43 
 
 		 163 aa  45.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00151639  normal  0.878549 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3247  integral membrane protein  29.92 
 
 		 168 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2896  putative tricarboxylic transport membrane protein  33.9 
 
 		 148 aa  42.4  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4540  hypothetical protein  29.23 
 
 		 156 aa  41.2  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3501  integral membrane protein  33.6 
 
 		 166 aa  40.8  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543403  normal  0.33628 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2049  putative tricarboxylic transporter, TctB (4TM)subunit  29.7 
 
 		 176 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0136396  normal  0.392165 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>