34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8067 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8067  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  335  2.9999999999999997e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37820  hypothetical protein  40.96 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.156933 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3501  integral membrane protein  42.74 
 
 		 166 aa  98.6  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543403  normal  0.33628 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3247  integral membrane protein  37.28 
 
 		 168 aa  97.4  8e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3236  integral membrane protein  36.69 
 
 		 168 aa  95.9  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.687326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3298  integral membrane protein  36.69 
 
 		 168 aa  95.9  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.172548  normal  0.0280313 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1828  hypothetical protein  35.15 
 
 		 204 aa  95.5  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.47902 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2147  hypothetical protein  35.08 
 
 		 198 aa  93.2  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0067  integral membrane protein  41.57 
 
 		 188 aa  92  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3005  integral membrane protein  40.32 
 
 		 172 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0295794 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0595  putative integral membrane protein  39.49 
 
 		 167 aa  85.1  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00342772 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1394  integral membrane protein  38.85 
 
 		 170 aa  81.6  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.070776  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3703  hypothetical protein  41.03 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00850  hypothetical protein  36.02 
 
 		 186 aa  78.2  0.00000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00463032  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4162  hypothetical protein  29.71 
 
 		 195 aa  78.2  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0836389  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0832  integral membrane protein  34.68 
 
 		 172 aa  75.5  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000357641  normal  0.309934 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3441  hypothetical protein  35.33 
 
 		 163 aa  73.6  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00151639  normal  0.878549 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0322  hypothetical protein  27.78 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.751848  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2568  hypothetical protein  35.14 
 
 		 164 aa  57  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0024808 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3626  integral membrane protein  40.23 
 
 		 171 aa  54.7  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3103  hypothetical protein  32 
 
 		 203 aa  53.9  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.531887  normal  0.721362 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3550  hypothetical protein  25.15 
 
 		 182 aa  52  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1998  hypothetical protein  32.05 
 
 		 153 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3430  hypothetical protein  25.33 
 
 		 157 aa  47.4  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.784858  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0733  hypothetical protein  29.33 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.59707  decreased coverage  0.00107456 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3967  membrane protein TctB, putative  30.87 
 
 		 152 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.605379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2000  hypothetical protein  32.69 
 
 		 153 aa  46.2  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3601  hypothetical protein  33.61 
 
 		 163 aa  45.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.243191  normal  0.0511186 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1637  TctB protein  27.7 
 
 		 145 aa  43.9  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1235  hypothetical protein  27.33 
 
 		 170 aa  43.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.422621 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0903  putative tricarboxylic transport membrane protein  26.62 
 
 		 147 aa  42.4  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.530268  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4233  membrane protein TctB, putative  32.03 
 
 		 152 aa  42.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1352  membrane protein TctB, putative  28.33 
 
 		 152 aa  42.4  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3135  hypothetical protein  33.09 
 
 		 173 aa  41.2  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.675068  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>