16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4540 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4540  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  307  4e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3010  hypothetical protein  39.49 
 
 		 157 aa  110  8.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.238808  normal  0.526573 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2222  hypothetical protein  42.68 
 
 		 157 aa  110  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3967  hypothetical protein  33.55 
 
 		 163 aa  81.6  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0072  hypothetical protein  35.44 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0377393  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4285  hypothetical protein  36.18 
 
 		 152 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1754  hypothetical protein  32.91 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0712518  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2440  hypothetical protein  29.22 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0482298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1800  hypothetical protein  27.08 
 
 		 146 aa  47  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.490656  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0733  hypothetical protein  32.21 
 
 		 143 aa  44.7  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.59707  decreased coverage  0.00107456 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0299  hypothetical protein  28.28 
 
 		 150 aa  42  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03669  hypothetical protein  27.78 
 
 		 168 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03720  conserved hypothetical protein  27.78 
 
 		 169 aa  42  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0609  hypothetical protein  36 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000785634  normal  0.0212075 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3967  membrane protein TctB, putative  24.84 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.605379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4210  hypothetical protein  27.08 
 
 		 168 aa  40.4  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433081 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>