36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3918 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_3918  putative tricarboxylic transport membrane protein  100 
 
 		 165 aa  327  4e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0635614  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6111  hypothetical protein  58.18 
 
 		 164 aa  184  6e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3635  hypothetical protein  57.43 
 
 		 163 aa  175  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3335  hypothetical protein  55.41 
 
 		 163 aa  168  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.122468 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4256  putative tricarboxylic transport membrane protein  55.83 
 
 		 163 aa  159  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.313811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3314  putative tricarboxylic transport membrane protein  60.26 
 
 		 161 aa  152  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188099  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0307  putative tricarboxylic transport membrane protein  45.96 
 
 		 164 aa  143  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1419  TRAP-T family transporter small inner membrane subunit  43.75 
 
 		 163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.218634  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3489  TRAP-T family transporter small inner membrane subunit  43.03 
 
 		 163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5906  putative tricarboxylic transport membrane protein  29.53 
 
 		 160 aa  72  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.896471  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3601  hypothetical protein  34.33 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.243191  normal  0.0511186 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0832  integral membrane protein  28.35 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000357641  normal  0.309934 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0322  hypothetical protein  30.73 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.751848  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3430  hypothetical protein  28.57 
 
 		 157 aa  52.4  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.784858  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3550  hypothetical protein  29.41 
 
 		 182 aa  48.9  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37820  hypothetical protein  26.29 
 
 		 186 aa  48.5  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.156933 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3501  integral membrane protein  30.08 
 
 		 166 aa  48.1  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543403  normal  0.33628 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2568  hypothetical protein  27.61 
 
 		 164 aa  47.8  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0024808 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3247  integral membrane protein  29.94 
 
 		 168 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0362  putative tricarboxylic transport membrane protein  29.14 
 
 		 157 aa  47  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3236  integral membrane protein  29.94 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.687326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3298  integral membrane protein  29.94 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.172548  normal  0.0280313 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3074  putative tricarboxylic transport membrane protein  31.25 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.183188 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4394  tricarboxylate transport protein TctB  29.17 
 
 		 152 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837927 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3009  hypothetical protein  25.84 
 
 		 178 aa  44.3  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.823092  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6184  putative tricarboxylic transport membrane protein  36 
 
 		 169 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0595  putative integral membrane protein  28.12 
 
 		 167 aa  43.1  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00342772 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2147  hypothetical protein  33.82 
 
 		 198 aa  42.4  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4162  hypothetical protein  23.33 
 
 		 195 aa  42.4  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0836389  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4304  hypothetical protein  28.77 
 
 		 152 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.836999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1643  hypothetical protein  24.5 
 
 		 183 aa  42  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0922744  normal  0.0412546 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3005  integral membrane protein  23.08 
 
 		 172 aa  41.6  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0295794 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1352  membrane protein TctB, putative  30.33 
 
 		 152 aa  41.2  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2519  hypothetical protein  23.03 
 
 		 189 aa  40.8  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0448156  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1417  tricarboxylate transport protein TctB, putative  28.57 
 
 		 161 aa  40.8  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.342625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1394  integral membrane protein  26.32 
 
 		 170 aa  40.4  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.070776  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>