24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0396 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0396  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  353  7.999999999999999e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.222332  normal  0.111519 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1235  hypothetical protein  57.99 
 
 		 170 aa  192  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.422621 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3009  hypothetical protein  57.71 
 
 		 178 aa  189  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.823092  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2568  hypothetical protein  58.75 
 
 		 164 aa  184  6e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0024808 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2010  hypothetical protein  53.67 
 
 		 184 aa  173  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.661275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2519  hypothetical protein  54.04 
 
 		 189 aa  165  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0448156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3010  hypothetical protein  52.75 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.313991  normal  0.844306 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2071  hypothetical protein  54.66 
 
 		 183 aa  158  3e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.953764  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1643  hypothetical protein  53.42 
 
 		 183 aa  154  5.0000000000000005e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0922744  normal  0.0412546 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3430  hypothetical protein  35.76 
 
 		 157 aa  93.6  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.784858  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3550  hypothetical protein  33.33 
 
 		 182 aa  87.8  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4256  putative tricarboxylic transport membrane protein  29.71 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.313811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8067  hypothetical protein  30.05 
 
 		 178 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0307  putative tricarboxylic transport membrane protein  25.58 
 
 		 164 aa  51.2  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1419  TRAP-T family transporter small inner membrane subunit  31.33 
 
 		 163 aa  50.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.218634  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3441  hypothetical protein  30.08 
 
 		 163 aa  50.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00151639  normal  0.878549 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3489  TRAP-T family transporter small inner membrane subunit  31.33 
 
 		 163 aa  49.7  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3918  putative tricarboxylic transport membrane protein  27.4 
 
 		 165 aa  49.7  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0635614  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3335  hypothetical protein  25.45 
 
 		 163 aa  48.5  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.122468 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0595  putative integral membrane protein  32.8 
 
 		 167 aa  48.5  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00342772 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3635  hypothetical protein  24.39 
 
 		 163 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1394  integral membrane protein  29.07 
 
 		 170 aa  44.3  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.070776  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6111  hypothetical protein  24.22 
 
 		 164 aa  43.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37820  hypothetical protein  32.06 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.156933 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>