19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2071 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2071  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  346  1e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.953764  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1643  hypothetical protein  98.36 
 
 		 183 aa  342  2e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0922744  normal  0.0412546 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2519  hypothetical protein  64.55 
 
 		 189 aa  226  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0448156  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3009  hypothetical protein  60.45 
 
 		 178 aa  201  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.823092  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3010  hypothetical protein  68.54 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.313991  normal  0.844306 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1235  hypothetical protein  59.01 
 
 		 170 aa  181  4.0000000000000006e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.422621 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2010  hypothetical protein  63.35 
 
 		 184 aa  177  5.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.661275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2568  hypothetical protein  56.44 
 
 		 164 aa  159  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0024808 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0396  hypothetical protein  55.71 
 
 		 183 aa  122  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.222332  normal  0.111519 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3430  hypothetical protein  35.98 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.784858  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3550  hypothetical protein  34.29 
 
 		 182 aa  81.3  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3635  hypothetical protein  27.38 
 
 		 163 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0307  putative tricarboxylic transport membrane protein  27.43 
 
 		 164 aa  52.8  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3335  hypothetical protein  27.27 
 
 		 163 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.122468 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4256  putative tricarboxylic transport membrane protein  28.47 
 
 		 163 aa  48.5  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.313811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6111  hypothetical protein  27.17 
 
 		 164 aa  45.4  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3074  putative tricarboxylic transport membrane protein  29.94 
 
 		 156 aa  42.4  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.183188 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5906  putative tricarboxylic transport membrane protein  32.43 
 
 		 160 aa  41.6  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.896471  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0733  hypothetical protein  31.33 
 
 		 143 aa  41.6  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.59707  decreased coverage  0.00107456 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>