13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3010 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3010  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  353  1e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.313991  normal  0.844306 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2519  hypothetical protein  76.5 
 
 		 189 aa  261  6e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0448156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2071  hypothetical protein  72.02 
 
 		 183 aa  219  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.953764  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3009  hypothetical protein  68.94 
 
 		 178 aa  219  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.823092  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1643  hypothetical protein  72.02 
 
 		 183 aa  218  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0922744  normal  0.0412546 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2010  hypothetical protein  65.17 
 
 		 184 aa  197  6e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.661275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1235  hypothetical protein  58.79 
 
 		 170 aa  184  6e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.422621 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2568  hypothetical protein  56.71 
 
 		 164 aa  173  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0024808 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0396  hypothetical protein  57.86 
 
 		 183 aa  131  5e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.222332  normal  0.111519 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3550  hypothetical protein  37.35 
 
 		 182 aa  95.1  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3430  hypothetical protein  36.14 
 
 		 157 aa  94  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.784858  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4256  putative tricarboxylic transport membrane protein  30.37 
 
 		 163 aa  45.1  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.313811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3635  hypothetical protein  27.22 
 
 		 163 aa  45.1  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>