35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3430 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A3430  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  307  4e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.784858  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3550  hypothetical protein  89.81 
 
 		 182 aa  288  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2568  hypothetical protein  38.55 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0024808 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1235  hypothetical protein  38.99 
 
 		 170 aa  97.1  9e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.422621 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3010  hypothetical protein  39.44 
 
 		 185 aa  92.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.313991  normal  0.844306 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3009  hypothetical protein  38.75 
 
 		 178 aa  91.7  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.823092  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2519  hypothetical protein  34.94 
 
 		 189 aa  88.2  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0448156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1643  hypothetical protein  36.59 
 
 		 183 aa  85.9  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0922744  normal  0.0412546 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2071  hypothetical protein  35.98 
 
 		 183 aa  82  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.953764  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2010  hypothetical protein  39.51 
 
 		 184 aa  75.1  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.661275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0396  hypothetical protein  39.01 
 
 		 183 aa  70.9  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.222332  normal  0.111519 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4256  putative tricarboxylic transport membrane protein  30.94 
 
 		 163 aa  66.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.313811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0307  putative tricarboxylic transport membrane protein  31.45 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3635  hypothetical protein  31.71 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37820  hypothetical protein  40.68 
 
 		 186 aa  57  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.156933 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3335  hypothetical protein  31.71 
 
 		 163 aa  57  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.122468 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6111  hypothetical protein  27.22 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0832  integral membrane protein  33.06 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000357641  normal  0.309934 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1419  TRAP-T family transporter small inner membrane subunit  30.4 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.218634  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3489  TRAP-T family transporter small inner membrane subunit  30.4 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3918  putative tricarboxylic transport membrane protein  28.57 
 
 		 165 aa  52.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0635614  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3103  hypothetical protein  33.73 
 
 		 203 aa  47.4  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.531887  normal  0.721362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8067  hypothetical protein  25.33 
 
 		 178 aa  47.4  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4162  hypothetical protein  32.2 
 
 		 195 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0836389  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0595  putative integral membrane protein  34.01 
 
 		 167 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00342772 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2147  hypothetical protein  29.45 
 
 		 198 aa  46.2  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3441  hypothetical protein  30.08 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00151639  normal  0.878549 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00850  hypothetical protein  29.11 
 
 		 186 aa  45.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00463032  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3314  putative tricarboxylic transport membrane protein  26.02 
 
 		 161 aa  45.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188099  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3601  hypothetical protein  30.58 
 
 		 163 aa  44.7  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.243191  normal  0.0511186 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3074  putative tricarboxylic transport membrane protein  30.38 
 
 		 156 aa  44.7  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.183188 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2074  hypothetical protein  26.09 
 
 		 169 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5906  putative tricarboxylic transport membrane protein  28.19 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.896471  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1394  integral membrane protein  34.78 
 
 		 170 aa  42  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.070776  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1391  cytochrome c, class I  34.48 
 
 		 151 aa  40.8  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>