17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2519 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2519  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  370  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0448156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3010  hypothetical protein  76.5 
 
 		 185 aa  234  8e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.313991  normal  0.844306 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2071  hypothetical protein  69.88 
 
 		 183 aa  223  9e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.953764  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1643  hypothetical protein  69.88 
 
 		 183 aa  223  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0922744  normal  0.0412546 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3009  hypothetical protein  68.32 
 
 		 178 aa  218  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.823092  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2010  hypothetical protein  64.32 
 
 		 184 aa  207  6e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.661275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1235  hypothetical protein  60.87 
 
 		 170 aa  194  8.000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.422621 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2568  hypothetical protein  51.55 
 
 		 164 aa  158  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0024808 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0396  hypothetical protein  55 
 
 		 183 aa  128  4.0000000000000003e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.222332  normal  0.111519 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3550  hypothetical protein  36.32 
 
 		 182 aa  95.1  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3430  hypothetical protein  34.94 
 
 		 157 aa  88.2  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.784858  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3635  hypothetical protein  25 
 
 		 163 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1419  TRAP-T family transporter small inner membrane subunit  28.15 
 
 		 163 aa  44.7  0.0009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.218634  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3335  hypothetical protein  24.52 
 
 		 163 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.122468 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3489  TRAP-T family transporter small inner membrane subunit  27.1 
 
 		 163 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4256  putative tricarboxylic transport membrane protein  28.12 
 
 		 163 aa  42  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.313811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2074  hypothetical protein  26.04 
 
 		 169 aa  41.2  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>