32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3489 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3489  TRAP-T family transporter small inner membrane subunit  100 
 
 		 163 aa  309  9e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1419  TRAP-T family transporter small inner membrane subunit  98.16 
 
 		 163 aa  304  3e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.218634  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0307  putative tricarboxylic transport membrane protein  56.13 
 
 		 164 aa  166  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3335  hypothetical protein  50.65 
 
 		 163 aa  159  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.122468 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6111  hypothetical protein  51.61 
 
 		 164 aa  157  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3635  hypothetical protein  50 
 
 		 163 aa  157  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4256  putative tricarboxylic transport membrane protein  51.95 
 
 		 163 aa  143  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.313811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3918  putative tricarboxylic transport membrane protein  43.12 
 
 		 165 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0635614  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3314  putative tricarboxylic transport membrane protein  49.33 
 
 		 161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188099  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3601  hypothetical protein  37.58 
 
 		 163 aa  70.1  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.243191  normal  0.0511186 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3550  hypothetical protein  31.67 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5906  putative tricarboxylic transport membrane protein  31.54 
 
 		 160 aa  62  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.896471  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3430  hypothetical protein  30.4 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.784858  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0362  putative tricarboxylic transport membrane protein  29.49 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3074  putative tricarboxylic transport membrane protein  31.76 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.183188 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6184  putative tricarboxylic transport membrane protein  35.4 
 
 		 169 aa  52.4  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2519  hypothetical protein  28.66 
 
 		 189 aa  51.2  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0448156  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3009  hypothetical protein  27.81 
 
 		 178 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.823092  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2568  hypothetical protein  28.67 
 
 		 164 aa  47.4  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0024808 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1235  hypothetical protein  30.52 
 
 		 170 aa  46.6  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.422621 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2071  hypothetical protein  28.39 
 
 		 183 aa  45.4  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.953764  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0832  integral membrane protein  30.08 
 
 		 172 aa  45.1  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000357641  normal  0.309934 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3967  hypothetical protein  26.8 
 
 		 163 aa  43.9  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4434  putative tricarboxylic transport membrane protein  28.79 
 
 		 146 aa  43.9  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0322  hypothetical protein  25.95 
 
 		 192 aa  43.9  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.751848  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1643  hypothetical protein  27.1 
 
 		 183 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0922744  normal  0.0412546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3247  integral membrane protein  30 
 
 		 168 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2449  hypothetical protein  27.97 
 
 		 146 aa  42.4  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3010  hypothetical protein  26.32 
 
 		 185 aa  41.6  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.313991  normal  0.844306 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3236  integral membrane protein  30 
 
 		 168 aa  41.2  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.687326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3298  integral membrane protein  30 
 
 		 168 aa  41.2  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.172548  normal  0.0280313 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2010  hypothetical protein  29.05 
 
 		 184 aa  40.4  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.661275  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>