18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3074 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3074  putative tricarboxylic transport membrane protein  100 
 
 		 156 aa  298  3e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.183188 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0362  putative tricarboxylic transport membrane protein  54.14 
 
 		 157 aa  164  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3601  hypothetical protein  39.24 
 
 		 163 aa  84.3  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.243191  normal  0.0511186 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6184  putative tricarboxylic transport membrane protein  38.96 
 
 		 169 aa  75.9  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3635  hypothetical protein  34.36 
 
 		 163 aa  66.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0307  putative tricarboxylic transport membrane protein  34.25 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3335  hypothetical protein  35.37 
 
 		 163 aa  63.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.122468 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3314  putative tricarboxylic transport membrane protein  39.32 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188099  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6111  hypothetical protein  31.87 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4256  putative tricarboxylic transport membrane protein  32.06 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.313811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2568  hypothetical protein  31.65 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0024808 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1419  TRAP-T family transporter small inner membrane subunit  44.83 
 
 		 163 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.218634  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3489  TRAP-T family transporter small inner membrane subunit  44.83 
 
 		 163 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5906  putative tricarboxylic transport membrane protein  35.26 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.896471  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3550  hypothetical protein  29.09 
 
 		 182 aa  47  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3430  hypothetical protein  30.38 
 
 		 157 aa  44.7  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.784858  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3918  putative tricarboxylic transport membrane protein  32.76 
 
 		 165 aa  44.3  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0635614  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0322  hypothetical protein  31.98 
 
 		 192 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.751848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>