31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3601 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3601  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  305  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.243191  normal  0.0511186 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0362  putative tricarboxylic transport membrane protein  43.36 
 
 		 157 aa  104  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3074  putative tricarboxylic transport membrane protein  39.24 
 
 		 156 aa  99.4  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.183188 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3635  hypothetical protein  35.8 
 
 		 163 aa  95.5  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3335  hypothetical protein  36.36 
 
 		 163 aa  95.5  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.122468 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0307  putative tricarboxylic transport membrane protein  37.82 
 
 		 164 aa  92  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6111  hypothetical protein  38.04 
 
 		 164 aa  90.1  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3489  TRAP-T family transporter small inner membrane subunit  37.5 
 
 		 163 aa  78.6  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1419  TRAP-T family transporter small inner membrane subunit  37.5 
 
 		 163 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.218634  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4256  putative tricarboxylic transport membrane protein  37.59 
 
 		 163 aa  76.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.313811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3918  putative tricarboxylic transport membrane protein  36.36 
 
 		 165 aa  74.7  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0635614  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3314  putative tricarboxylic transport membrane protein  41.38 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188099  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6184  putative tricarboxylic transport membrane protein  39.8 
 
 		 169 aa  64.3  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3430  hypothetical protein  33.61 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.784858  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3967  hypothetical protein  27.63 
 
 		 163 aa  50.8  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3550  hypothetical protein  30.51 
 
 		 182 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8067  hypothetical protein  34.88 
 
 		 178 aa  47.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0322  hypothetical protein  28.41 
 
 		 192 aa  47.8  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.751848  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3247  integral membrane protein  30.06 
 
 		 168 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0832  integral membrane protein  29.76 
 
 		 172 aa  47  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000357641  normal  0.309934 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3441  hypothetical protein  30.89 
 
 		 163 aa  46.6  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00151639  normal  0.878549 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3236  integral membrane protein  29.48 
 
 		 168 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.687326  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37820  hypothetical protein  27.37 
 
 		 186 aa  45.1  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.156933 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2519  hypothetical protein  28.81 
 
 		 189 aa  45.1  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0448156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3298  integral membrane protein  29.48 
 
 		 168 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.172548  normal  0.0280313 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3501  integral membrane protein  28.67 
 
 		 166 aa  44.3  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543403  normal  0.33628 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00850  hypothetical protein  28.25 
 
 		 186 aa  42.4  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00463032  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4162  hypothetical protein  30.25 
 
 		 195 aa  42  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0836389  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3005  integral membrane protein  27.75 
 
 		 172 aa  41.2  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0295794 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0595  putative integral membrane protein  27.85 
 
 		 167 aa  40.8  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00342772 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5906  putative tricarboxylic transport membrane protein  29.14 
 
 		 160 aa  40.8  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.896471  normal  0.308497 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>