14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6184 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6184  putative tricarboxylic transport membrane protein  100 
 
 		 169 aa  321  3e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0362  putative tricarboxylic transport membrane protein  38.96 
 
 		 157 aa  94  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3074  putative tricarboxylic transport membrane protein  38.96 
 
 		 156 aa  90.9  8e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.183188 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3335  hypothetical protein  33.93 
 
 		 163 aa  72.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.122468 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3635  hypothetical protein  33.33 
 
 		 163 aa  67.8  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3601  hypothetical protein  35.51 
 
 		 163 aa  63.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.243191  normal  0.0511186 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6111  hypothetical protein  36.36 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3314  putative tricarboxylic transport membrane protein  38.89 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188099  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0307  putative tricarboxylic transport membrane protein  35.2 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4256  putative tricarboxylic transport membrane protein  33.33 
 
 		 163 aa  52.8  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.313811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3918  putative tricarboxylic transport membrane protein  30.28 
 
 		 165 aa  49.7  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0635614  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3489  TRAP-T family transporter small inner membrane subunit  38.76 
 
 		 163 aa  48.9  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1419  TRAP-T family transporter small inner membrane subunit  37.98 
 
 		 163 aa  48.1  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.218634  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0832  integral membrane protein  33.6 
 
 		 172 aa  43.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000357641  normal  0.309934 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>