16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1235 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1235  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  335  9.999999999999999e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.422621 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3009  hypothetical protein  63.35 
 
 		 178 aa  202  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.823092  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2519  hypothetical protein  60.87 
 
 		 189 aa  194  6e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0448156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2010  hypothetical protein  63.75 
 
 		 184 aa  189  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.661275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2568  hypothetical protein  58.08 
 
 		 164 aa  187  4e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0024808 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2071  hypothetical protein  59.01 
 
 		 183 aa  181  4.0000000000000006e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.953764  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1643  hypothetical protein  58.39 
 
 		 183 aa  180  7e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0922744  normal  0.0412546 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3010  hypothetical protein  59.31 
 
 		 185 aa  166  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.313991  normal  0.844306 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0396  hypothetical protein  61.43 
 
 		 183 aa  151  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.222332  normal  0.111519 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3550  hypothetical protein  38.86 
 
 		 182 aa  98.6  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3430  hypothetical protein  38.99 
 
 		 157 aa  97.1  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.784858  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4256  putative tricarboxylic transport membrane protein  28.91 
 
 		 163 aa  44.7  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.313811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8067  hypothetical protein  27.33 
 
 		 178 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3135  hypothetical protein  32.33 
 
 		 173 aa  42.7  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.675068  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3441  hypothetical protein  25.86 
 
 		 163 aa  42.4  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00151639  normal  0.878549 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2074  hypothetical protein  23.81 
 
 		 169 aa  41.2  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>