45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3213 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3213  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  314  4e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3881  hypothetical protein  62.96 
 
 		 162 aa  210  7e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.559806  normal  0.665493 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2746  protein of unknown function DUF1468  63.58 
 
 		 162 aa  209  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1250  protein of unknown function DUF1468  60.49 
 
 		 162 aa  207  4e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0318  protein of unknown function DUF1468  59.26 
 
 		 162 aa  204  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3238  hypothetical protein  61.11 
 
 		 162 aa  199  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.020333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4019  hypothetical protein  54.6 
 
 		 191 aa  197  3.9999999999999996e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.242542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3412  hypothetical protein  64.2 
 
 		 162 aa  194  6e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5394  hypothetical protein  57.41 
 
 		 162 aa  192  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1069  hypothetical protein  62.96 
 
 		 162 aa  191  3e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6377  protein of unknown function DUF1468  57.41 
 
 		 162 aa  166  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70314  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2305  hypothetical protein  46.3 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3057  hypothetical protein  46.2 
 
 		 154 aa  117  7e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.542424 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1720  hypothetical protein  36.31 
 
 		 152 aa  101  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.518273  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3963  hypothetical protein  34.57 
 
 		 164 aa  100  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511575  normal  0.0273458 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1438  protein of unknown function DUF1468  36.71 
 
 		 153 aa  87.8  5e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.832604 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0794  hypothetical protein  39.38 
 
 		 161 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3643  hypothetical protein  36.42 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.025791  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0845  hypothetical protein  37.34 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489903  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0826  hypothetical protein  36.08 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0445007 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3298  hypothetical protein  35.9 
 
 		 150 aa  79.7  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.667523  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4403  hypothetical protein  37.88 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.209294  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2388  hypothetical protein  30.26 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.0000543709  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4103  hypothetical protein  36.11 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.403787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1908a  hypothetical protein  35.71 
 
 		 187 aa  67  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0741  protein of unknown function DUF1468  38.99 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.48344  normal  0.546388 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0811  protein of unknown function DUF1468  40.25 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1331  hypothetical protein  34.69 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3422  hypothetical protein  35.66 
 
 		 175 aa  60.8  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113281  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3167  protein of unknown function DUF1468  35.66 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2146  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  32.45 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2515  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  30.2 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.964396  normal  0.161309 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3458  protein of unknown function DUF1468  34.97 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0197428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2564  protein of unknown function DUF1468  34.18 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5652  hypothetical protein  29.22 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0445869 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1017  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  30 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.059045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4451  hypothetical protein  34.57 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150747 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6102  hypothetical protein  29.19 
 
 		 259 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21280  hypothetical protein  37.78 
 
 		 152 aa  48.9  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.24401  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2919  hypothetical protein  30.26 
 
 		 175 aa  47.4  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169398  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3269  hypothetical protein  26.21 
 
 		 259 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.170183  normal  0.426633 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7082  hypothetical protein  26.62 
 
 		 153 aa  45.1  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2033  tripartite tricarboxylate transporter TctA  26.42 
 
 		 166 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3223  hypothetical protein  30.63 
 
 		 149 aa  45.1  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.663064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3289  hypothetical protein  30.38 
 
 		 151 aa  44.7  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.17193  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>