51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0741 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0741  protein of unknown function DUF1468  100 
 
 		 152 aa  291  2e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.48344  normal  0.546388 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0794  hypothetical protein  89.4 
 
 		 161 aa  222  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0811  protein of unknown function DUF1468  96.69 
 
 		 161 aa  214  4e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3963  hypothetical protein  66.44 
 
 		 164 aa  200  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511575  normal  0.0273458 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0826  hypothetical protein  66.23 
 
 		 153 aa  173  8e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0445007 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3643  hypothetical protein  67.79 
 
 		 153 aa  169  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.025791  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0845  hypothetical protein  65.56 
 
 		 153 aa  164  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489903  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1720  hypothetical protein  45.64 
 
 		 152 aa  147  5e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.518273  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1438  protein of unknown function DUF1468  48.99 
 
 		 153 aa  136  8.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.832604 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5394  hypothetical protein  42.5 
 
 		 162 aa  116  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0318  protein of unknown function DUF1468  40 
 
 		 162 aa  111  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1250  protein of unknown function DUF1468  39.24 
 
 		 162 aa  111  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2746  protein of unknown function DUF1468  38.61 
 
 		 162 aa  110  5e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4019  hypothetical protein  35.29 
 
 		 191 aa  106  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.242542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3057  hypothetical protein  44.44 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.542424 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3238  hypothetical protein  39.24 
 
 		 162 aa  104  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.020333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3881  hypothetical protein  40.25 
 
 		 162 aa  104  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.559806  normal  0.665493 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1069  hypothetical protein  42.59 
 
 		 162 aa  102  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3412  hypothetical protein  39.87 
 
 		 162 aa  101  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2305  hypothetical protein  44 
 
 		 154 aa  96.7  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6377  protein of unknown function DUF1468  42.14 
 
 		 162 aa  94  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70314  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3213  hypothetical protein  39.87 
 
 		 163 aa  87.8  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3298  hypothetical protein  35.42 
 
 		 150 aa  87.4  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.667523  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2564  protein of unknown function DUF1468  37.5 
 
 		 158 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2919  hypothetical protein  32.17 
 
 		 175 aa  71.6  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169398  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4103  hypothetical protein  33.58 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.403787  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3458  protein of unknown function DUF1468  35.82 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0197428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3167  protein of unknown function DUF1468  37.31 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2146  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  31.94 
 
 		 162 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3223  hypothetical protein  29.53 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.663064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1908a  hypothetical protein  27.81 
 
 		 187 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0414  hypothetical protein  32.1 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7082  hypothetical protein  29.66 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3250  hypothetical protein  27.59 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.450791  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0554  hypothetical protein  35.53 
 
 		 169 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.740481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1331  hypothetical protein  37.5 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4403  hypothetical protein  35.04 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.209294  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2388  hypothetical protein  27.01 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.0000543709  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1017  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  28.08 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.059045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5652  hypothetical protein  26.17 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0445869 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4451  hypothetical protein  34.21 
 
 		 148 aa  52.8  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150747 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3289  hypothetical protein  27.59 
 
 		 151 aa  51.6  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.17193  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3422  hypothetical protein  34.51 
 
 		 175 aa  50.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113281  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6102  hypothetical protein  33.56 
 
 		 259 aa  47.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4010  protein of unknown function DUF1468  28.19 
 
 		 166 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2515  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  25.5 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.964396  normal  0.161309 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3269  hypothetical protein  30.7 
 
 		 259 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.170183  normal  0.426633 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1699  protein of unknown function DUF1468  31.51 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00744952  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1626  protein of unknown function DUF1468  31.51 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.342281  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3273  hypothetical protein  22.92 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.310623  normal  0.268735 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2247  hypothetical protein  31.51 
 
 		 214 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>