32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0414 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0414  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  317  3e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3963  hypothetical protein  33.33 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511575  normal  0.0273458 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1908a  hypothetical protein  37.76 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3298  hypothetical protein  31.03 
 
 		 150 aa  62  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.667523  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2146  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  32.72 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4103  hypothetical protein  33.33 
 
 		 153 aa  60.5  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.403787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5652  hypothetical protein  33.1 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0445869 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3881  hypothetical protein  29.27 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.559806  normal  0.665493 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3238  hypothetical protein  32.19 
 
 		 162 aa  57  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.020333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5394  hypothetical protein  31.25 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3643  hypothetical protein  34 
 
 		 153 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.025791  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2746  protein of unknown function DUF1468  29.75 
 
 		 162 aa  53.1  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4403  hypothetical protein  32.33 
 
 		 154 aa  53.1  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.209294  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1250  protein of unknown function DUF1468  28.57 
 
 		 162 aa  52.4  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0845  hypothetical protein  32 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489903  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7082  hypothetical protein  31.51 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6102  hypothetical protein  29.84 
 
 		 259 aa  48.9  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3412  hypothetical protein  27.85 
 
 		 162 aa  48.1  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3358  hypothetical protein  37.84 
 
 		 166 aa  47.8  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0103855 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1017  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  28.57 
 
 		 159 aa  47.8  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.059045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1720  hypothetical protein  28.67 
 
 		 152 aa  47.4  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.518273  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4019  hypothetical protein  27.56 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.242542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2515  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  30.12 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.964396  normal  0.161309 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0826  hypothetical protein  31.33 
 
 		 153 aa  44.3  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0445007 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1069  hypothetical protein  31.97 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0318  protein of unknown function DUF1468  30.22 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2033  tripartite tricarboxylate transporter TctA  36.11 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1318  hypothetical protein  30.68 
 
 		 221 aa  42  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356534  normal  0.417426 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1514  hypothetical protein  30.68 
 
 		 221 aa  42  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0554  hypothetical protein  29.93 
 
 		 169 aa  41.6  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.740481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3422  hypothetical protein  35.04 
 
 		 175 aa  40.8  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113281  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6377  protein of unknown function DUF1468  31.21 
 
 		 162 aa  40.8  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70314  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>