35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6102 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6102  hypothetical protein  100 
 
 		 259 aa  496  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3269  hypothetical protein  58.2 
 
 		 259 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.170183  normal  0.426633 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2033  tripartite tricarboxylate transporter TctA  63.51 
 
 		 166 aa  175  6e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3358  hypothetical protein  64.38 
 
 		 166 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0103855 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4010  protein of unknown function DUF1468  62.16 
 
 		 166 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0554  hypothetical protein  41.26 
 
 		 169 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.740481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1514  hypothetical protein  38.61 
 
 		 221 aa  92  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1318  hypothetical protein  38.61 
 
 		 221 aa  92  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356534  normal  0.417426 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1699  protein of unknown function DUF1468  38.73 
 
 		 166 aa  85.9  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00744952  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1626  protein of unknown function DUF1468  38.73 
 
 		 166 aa  85.9  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.342281  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2247  hypothetical protein  38.89 
 
 		 214 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3298  hypothetical protein  40 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.667523  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5394  hypothetical protein  31.68 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3881  hypothetical protein  28.66 
 
 		 162 aa  60.5  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.559806  normal  0.665493 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2746  protein of unknown function DUF1468  27.95 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1250  protein of unknown function DUF1468  25.62 
 
 		 162 aa  57.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3238  hypothetical protein  27.39 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.020333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3963  hypothetical protein  26.17 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511575  normal  0.0273458 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7082  hypothetical protein  32.87 
 
 		 153 aa  53.5  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3223  hypothetical protein  29.66 
 
 		 149 aa  51.2  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.663064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2146  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  29.58 
 
 		 162 aa  49.7  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0414  hypothetical protein  29.84 
 
 		 168 aa  48.9  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3289  hypothetical protein  29.66 
 
 		 151 aa  47.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.17193  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1908a  hypothetical protein  27.03 
 
 		 187 aa  47  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0318  protein of unknown function DUF1468  27.95 
 
 		 162 aa  47.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3412  hypothetical protein  26.71 
 
 		 162 aa  46.6  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1331  hypothetical protein  34.26 
 
 		 153 aa  46.6  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1720  hypothetical protein  24.32 
 
 		 152 aa  45.8  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.518273  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4403  hypothetical protein  33.33 
 
 		 154 aa  45.8  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.209294  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4019  hypothetical protein  25.43 
 
 		 191 aa  45.4  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.242542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1017  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  26.85 
 
 		 159 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.059045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1069  hypothetical protein  27.5 
 
 		 162 aa  43.9  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1438  protein of unknown function DUF1468  28.1 
 
 		 153 aa  43.1  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.832604 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2564  protein of unknown function DUF1468  34.18 
 
 		 158 aa  42.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5652  hypothetical protein  26.35 
 
 		 160 aa  42  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0445869 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>