38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5652 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5652  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  322  2e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0445869 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1017  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  55.41 
 
 		 159 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.059045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2146  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  51.57 
 
 		 162 aa  161  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1908a  hypothetical protein  46.45 
 
 		 187 aa  158  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2515  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  52.6 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.964396  normal  0.161309 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5394  hypothetical protein  30.32 
 
 		 162 aa  73.6  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4019  hypothetical protein  29.59 
 
 		 191 aa  70.5  0.000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.242542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3963  hypothetical protein  30.2 
 
 		 164 aa  70.5  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511575  normal  0.0273458 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1250  protein of unknown function DUF1468  30.57 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3223  hypothetical protein  30.72 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.663064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3238  hypothetical protein  27.5 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.020333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2919  hypothetical protein  29.8 
 
 		 175 aa  59.7  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169398  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0414  hypothetical protein  33.1 
 
 		 168 aa  58.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2746  protein of unknown function DUF1468  28.03 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3881  hypothetical protein  28.3 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.559806  normal  0.665493 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1069  hypothetical protein  32.48 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0318  protein of unknown function DUF1468  28.95 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1720  hypothetical protein  27.15 
 
 		 152 aa  52.4  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.518273  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7082  hypothetical protein  24.36 
 
 		 153 aa  50.8  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3289  hypothetical protein  35.25 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.17193  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3298  hypothetical protein  26.14 
 
 		 150 aa  47.8  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.667523  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2388  hypothetical protein  22.37 
 
 		 150 aa  47.8  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.0000543709  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3412  hypothetical protein  28.03 
 
 		 162 aa  47.8  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0554  hypothetical protein  28.97 
 
 		 169 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.740481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2564  protein of unknown function DUF1468  26.57 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3643  hypothetical protein  29.53 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.025791  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3213  hypothetical protein  29.22 
 
 		 163 aa  45.1  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2305  hypothetical protein  29.47 
 
 		 154 aa  45.1  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4403  hypothetical protein  24.8 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.209294  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3250  hypothetical protein  28.76 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.450791  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3273  hypothetical protein  30.26 
 
 		 140 aa  43.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.310623  normal  0.268735 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3197  hypothetical protein  27.5 
 
 		 170 aa  42.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00506023  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6102  hypothetical protein  26.35 
 
 		 259 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0794  hypothetical protein  29.69 
 
 		 161 aa  41.6  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4103  hypothetical protein  25.69 
 
 		 153 aa  41.2  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.403787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0826  hypothetical protein  27.52 
 
 		 153 aa  40.8  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0445007 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6377  protein of unknown function DUF1468  26.09 
 
 		 162 aa  40.8  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70314  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1438  protein of unknown function DUF1468  33.93 
 
 		 153 aa  40.8  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.832604 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>