43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4103 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4103  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  295  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.403787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3167  protein of unknown function DUF1468  71.9 
 
 		 153 aa  201  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3458  protein of unknown function DUF1468  69.93 
 
 		 153 aa  197  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0197428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3422  hypothetical protein  69.74 
 
 		 175 aa  184  5e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113281  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4403  hypothetical protein  58.44 
 
 		 154 aa  167  5e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.209294  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1331  hypothetical protein  43.85 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3298  hypothetical protein  38.24 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.667523  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3963  hypothetical protein  35.2 
 
 		 164 aa  70.5  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511575  normal  0.0273458 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0554  hypothetical protein  32.35 
 
 		 169 aa  67  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.740481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1720  hypothetical protein  32.84 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.518273  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3289  hypothetical protein  38.46 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.17193  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1250  protein of unknown function DUF1468  31.25 
 
 		 162 aa  61.6  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2746  protein of unknown function DUF1468  33.09 
 
 		 162 aa  60.8  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0414  hypothetical protein  33.33 
 
 		 168 aa  60.5  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2388  hypothetical protein  28.57 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.0000543709  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6377  protein of unknown function DUF1468  34.27 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70314  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4019  hypothetical protein  29.81 
 
 		 191 aa  57.4  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.242542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3213  hypothetical protein  35.42 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3643  hypothetical protein  37.6 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.025791  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3250  hypothetical protein  32.86 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.450791  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0845  hypothetical protein  38.4 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489903  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3223  hypothetical protein  32.73 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.663064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1908a  hypothetical protein  30.07 
 
 		 187 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3881  hypothetical protein  31.9 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.559806  normal  0.665493 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0318  protein of unknown function DUF1468  31.25 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5394  hypothetical protein  30.15 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2564  protein of unknown function DUF1468  33.83 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3412  hypothetical protein  33.09 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3238  hypothetical protein  33.03 
 
 		 162 aa  51.2  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.020333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2919  hypothetical protein  28.79 
 
 		 175 aa  50.8  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169398  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1017  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  27.86 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.059045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2146  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  27.33 
 
 		 162 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3057  hypothetical protein  33.82 
 
 		 154 aa  47  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.542424 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2033  tripartite tricarboxylate transporter TctA  29.66 
 
 		 166 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0826  hypothetical protein  35.2 
 
 		 153 aa  44.7  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0445007 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7082  hypothetical protein  26.71 
 
 		 153 aa  45.1  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1069  hypothetical protein  31.72 
 
 		 162 aa  44.3  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1438  protein of unknown function DUF1468  32.09 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.832604 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4451  hypothetical protein  28.77 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150747 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5652  hypothetical protein  25.69 
 
 		 160 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0445869 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6102  hypothetical protein  27.61 
 
 		 259 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3358  hypothetical protein  33.33 
 
 		 166 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0103855 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0794  hypothetical protein  34.13 
 
 		 161 aa  40.4  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>