50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4403 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4403  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  295  2e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.209294  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4103  hypothetical protein  58.44 
 
 		 153 aa  173  8e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.403787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3167  protein of unknown function DUF1468  57.79 
 
 		 153 aa  157  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3422  hypothetical protein  63.51 
 
 		 175 aa  155  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113281  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3458  protein of unknown function DUF1468  56.49 
 
 		 153 aa  154  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0197428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2746  protein of unknown function DUF1468  34.21 
 
 		 162 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1331  hypothetical protein  40.91 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3412  hypothetical protein  34.21 
 
 		 162 aa  73.9  0.0000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3289  hypothetical protein  37.68 
 
 		 151 aa  73.9  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.17193  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1250  protein of unknown function DUF1468  31.37 
 
 		 162 aa  72  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3213  hypothetical protein  36.84 
 
 		 163 aa  70.5  0.000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0318  protein of unknown function DUF1468  31.37 
 
 		 162 aa  68.6  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3298  hypothetical protein  35.04 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.667523  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3881  hypothetical protein  32.67 
 
 		 162 aa  67.8  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.559806  normal  0.665493 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4019  hypothetical protein  30.12 
 
 		 191 aa  67  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.242542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3963  hypothetical protein  28.37 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511575  normal  0.0273458 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1720  hypothetical protein  29.17 
 
 		 152 aa  65.9  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.518273  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2388  hypothetical protein  29.73 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.0000543709  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6377  protein of unknown function DUF1468  33.33 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70314  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3238  hypothetical protein  32 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.020333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0554  hypothetical protein  33.09 
 
 		 169 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.740481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5394  hypothetical protein  27.63 
 
 		 162 aa  60.8  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1069  hypothetical protein  32.89 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1438  protein of unknown function DUF1468  34.69 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.832604 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3057  hypothetical protein  35.92 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.542424 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3223  hypothetical protein  33.33 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.663064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7082  hypothetical protein  31.97 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6102  hypothetical protein  33.33 
 
 		 259 aa  54.3  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1908a  hypothetical protein  32.28 
 
 		 187 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2919  hypothetical protein  30.5 
 
 		 175 aa  53.5  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169398  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2564  protein of unknown function DUF1468  36.08 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0414  hypothetical protein  31.25 
 
 		 168 aa  53.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1626  protein of unknown function DUF1468  37.5 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.342281  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1699  protein of unknown function DUF1468  37.5 
 
 		 166 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00744952  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2033  tripartite tricarboxylate transporter TctA  36.36 
 
 		 166 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2247  hypothetical protein  37.5 
 
 		 214 aa  50.4  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1017  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  28.28 
 
 		 159 aa  50.8  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.059045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3269  hypothetical protein  31.3 
 
 		 259 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.170183  normal  0.426633 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3643  hypothetical protein  30.94 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.025791  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3250  hypothetical protein  34.53 
 
 		 165 aa  49.7  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.450791  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0845  hypothetical protein  30.22 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489903  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4451  hypothetical protein  34.04 
 
 		 148 aa  48.9  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150747 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3358  hypothetical protein  33.77 
 
 		 166 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0103855 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2146  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  31.54 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0794  hypothetical protein  34.97 
 
 		 161 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4010  protein of unknown function DUF1468  35.53 
 
 		 166 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5652  hypothetical protein  24.8 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0445869 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2515  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  31.85 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.964396  normal  0.161309 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2305  hypothetical protein  30.71 
 
 		 154 aa  42.4  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0826  hypothetical protein  27.03 
 
 		 153 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0445007 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>