46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3289 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3289  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  287  3e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.17193  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4403  hypothetical protein  39.34 
 
 		 154 aa  79.3  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.209294  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4103  hypothetical protein  38.46 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.403787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3167  protein of unknown function DUF1468  39.16 
 
 		 153 aa  77  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3458  protein of unknown function DUF1468  37.76 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0197428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3963  hypothetical protein  30.34 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511575  normal  0.0273458 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3298  hypothetical protein  37.58 
 
 		 150 aa  72  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.667523  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0554  hypothetical protein  36.51 
 
 		 169 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.740481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1699  protein of unknown function DUF1468  41.43 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00744952  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1626  protein of unknown function DUF1468  41.43 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.342281  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2247  hypothetical protein  41.43 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1250  protein of unknown function DUF1468  32.28 
 
 		 162 aa  68.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2146  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  33.33 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2746  protein of unknown function DUF1468  29.01 
 
 		 162 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5652  hypothetical protein  34.35 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0445869 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0318  protein of unknown function DUF1468  27.92 
 
 		 162 aa  63.9  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3412  hypothetical protein  29.63 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3223  hypothetical protein  35.71 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.663064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1017  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  34.88 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.059045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3422  hypothetical protein  42.52 
 
 		 175 aa  62.4  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113281  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4019  hypothetical protein  28.16 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.242542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5394  hypothetical protein  27.85 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1720  hypothetical protein  28.28 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.518273  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3643  hypothetical protein  30.34 
 
 		 153 aa  51.2  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.025791  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3238  hypothetical protein  26.62 
 
 		 162 aa  50.8  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.020333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4451  hypothetical protein  29.79 
 
 		 148 aa  50.4  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150747 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0845  hypothetical protein  28.97 
 
 		 153 aa  50.4  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489903  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1069  hypothetical protein  27.85 
 
 		 162 aa  49.7  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1908a  hypothetical protein  29.92 
 
 		 187 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6102  hypothetical protein  29.66 
 
 		 259 aa  49.7  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2919  hypothetical protein  32.19 
 
 		 175 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169398  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0414  hypothetical protein  32.35 
 
 		 168 aa  48.5  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2564  protein of unknown function DUF1468  31.79 
 
 		 158 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2388  hypothetical protein  24.81 
 
 		 150 aa  47.8  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.0000543709  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3881  hypothetical protein  25.32 
 
 		 162 aa  47.8  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.559806  normal  0.665493 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0826  hypothetical protein  29.66 
 
 		 153 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0445007 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3213  hypothetical protein  30.38 
 
 		 163 aa  47.4  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2033  tripartite tricarboxylate transporter TctA  34.21 
 
 		 166 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7082  hypothetical protein  29.63 
 
 		 153 aa  44.7  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3358  hypothetical protein  34.72 
 
 		 166 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0103855 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0794  hypothetical protein  27.59 
 
 		 161 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1318  hypothetical protein  29.75 
 
 		 221 aa  41.2  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356534  normal  0.417426 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1514  hypothetical protein  29.75 
 
 		 221 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2305  hypothetical protein  26.03 
 
 		 154 aa  40.8  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3269  hypothetical protein  25.19 
 
 		 259 aa  40.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.170183  normal  0.426633 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3057  hypothetical protein  29.33 
 
 		 154 aa  40.4  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.542424 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>