54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1331 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1331  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  287  4e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4103  hypothetical protein  44.44 
 
 
153 aa  110  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.403787  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4403  hypothetical protein  42.18 
 
 
154 aa  102  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.209294  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3167  protein of unknown function DUF1468  46.21 
 
 
153 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139104  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3458  protein of unknown function DUF1468  44.14 
 
 
153 aa  99  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0197428  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1720  hypothetical protein  39.31 
 
 
152 aa  97.8  5e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.518273  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3422  hypothetical protein  43.75 
 
 
175 aa  90.5  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113281  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3963  hypothetical protein  38.19 
 
 
164 aa  88.6  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511575  normal  0.0273458 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1438  protein of unknown function DUF1468  42.76 
 
 
153 aa  84.7  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.832604 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2746  protein of unknown function DUF1468  32.68 
 
 
162 aa  77.4  0.00000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1250  protein of unknown function DUF1468  35.1 
 
 
162 aa  76.3  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3643  hypothetical protein  38.19 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.025791  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2305  hypothetical protein  37.93 
 
 
154 aa  73.2  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3298  hypothetical protein  33.1 
 
 
150 aa  68.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.667523  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5394  hypothetical protein  28.1 
 
 
162 aa  67.4  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0845  hypothetical protein  37.5 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489903  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4019  hypothetical protein  29.09 
 
 
191 aa  65.1  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.242542  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3881  hypothetical protein  41.11 
 
 
162 aa  64.7  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.559806  normal  0.665493 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3238  hypothetical protein  29.41 
 
 
162 aa  63.9  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.020333  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3213  hypothetical protein  34.69 
 
 
163 aa  63.2  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3412  hypothetical protein  32.68 
 
 
162 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3057  hypothetical protein  34.87 
 
 
154 aa  62.8  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.542424 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0826  hypothetical protein  38.19 
 
 
153 aa  62.8  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0445007 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21280  hypothetical protein  39.6 
 
 
152 aa  59.7  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.24401  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0794  hypothetical protein  37.5 
 
 
161 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6102  hypothetical protein  31.91 
 
 
259 aa  58.9  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0318  protein of unknown function DUF1468  28.1 
 
 
162 aa  57.8  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3223  hypothetical protein  26.53 
 
 
149 aa  56.2  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.663064  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1017  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  31.29 
 
 
159 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.059045  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3269  hypothetical protein  32.11 
 
 
259 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.170183  normal  0.426633 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4010  protein of unknown function DUF1468  33.1 
 
 
166 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7082  hypothetical protein  30.5 
 
 
153 aa  55.5  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0554  hypothetical protein  29.37 
 
 
169 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.740481  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2515  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  29.25 
 
 
160 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.964396  normal  0.161309 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6377  protein of unknown function DUF1468  33.33 
 
 
162 aa  51.2  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70314  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2388  hypothetical protein  30.71 
 
 
150 aa  51.2  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.0000543709  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1069  hypothetical protein  35.37 
 
 
162 aa  50.4  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3289  hypothetical protein  36.84 
 
 
151 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.17193  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2033  tripartite tricarboxylate transporter TctA  32.19 
 
 
166 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1800  hypothetical protein  31.43 
 
 
146 aa  48.9  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.490656  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0414  hypothetical protein  30.19 
 
 
168 aa  48.5  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3273  hypothetical protein  27.86 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.310623  normal  0.268735 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5652  hypothetical protein  28.38 
 
 
160 aa  47.4  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0445869 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2564  protein of unknown function DUF1468  31.72 
 
 
158 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2146  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctB  28.38 
 
 
162 aa  45.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0741  protein of unknown function DUF1468  48.84 
 
 
152 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.48344  normal  0.546388 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1908a  hypothetical protein  29.53 
 
 
187 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0811  protein of unknown function DUF1468  48.84 
 
 
161 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1514  hypothetical protein  29.47 
 
 
221 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1318  hypothetical protein  29.47 
 
 
221 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356534  normal  0.417426 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3358  hypothetical protein  30.28 
 
 
166 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0103855 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3250  hypothetical protein  32.11 
 
 
165 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.450791  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2919  hypothetical protein  25.53 
 
 
175 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169398  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4451  hypothetical protein  33.33 
 
 
148 aa  41.6  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.150747 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>