17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2791 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2791  putative tricarboxylate transport protein TctB  100 
 
 
151 aa  296  5e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0621  putative tricarboxylate transport protein TctB  31.51 
 
 
154 aa  54.7  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3441  hypothetical protein  24.83 
 
 
163 aa  53.5  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00151639  normal  0.878549 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6111  hypothetical protein  31.72 
 
 
164 aa  53.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4256  putative tricarboxylic transport membrane protein  28.57 
 
 
163 aa  49.7  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.313811  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1720  hypothetical protein  25.97 
 
 
152 aa  47.8  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.518273  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2519  hypothetical protein  31.48 
 
 
189 aa  47.8  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0448156  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0337  hypothetical protein  27.94 
 
 
149 aa  46.6  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3963  hypothetical protein  28.3 
 
 
164 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511575  normal  0.0273458 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1235  hypothetical protein  26.9 
 
 
170 aa  45.1  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.422621 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2222  putative tricarboxylic transporter, TctB (4TM)subunit  26.8 
 
 
172 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0953872  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3247  integral membrane protein  28 
 
 
168 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0483  hypothetical protein  23.49 
 
 
171 aa  41.6  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3298  integral membrane protein  28.24 
 
 
168 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.172548  normal  0.0280313 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3236  integral membrane protein  28.24 
 
 
168 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.687326  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3635  hypothetical protein  30.28 
 
 
163 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3057  hypothetical protein  30.2 
 
 
154 aa  40  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.542424 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>