46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3098 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3098  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 225 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.243755  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0114  transcriptional regulator, TetR family  27.55 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.621262  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2695  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.945572  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  35.45 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1923  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 223 aa  52  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6886  TetR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 239 aa  50.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2871  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 213 aa  48.9  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  31.34 
 
 		 224 aa  48.5  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 236 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 237 aa  47.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  37.39 
 
 		 196 aa  45.8  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 207 aa  45.8  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 236 aa  45.8  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  24.35 
 
 		 201 aa  45.4  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0356  transcriptional regulator, TetR family  37.27 
 
 		 235 aa  45.1  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00145185  hitchhiker  0.0000223354 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8200  putative transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 237 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 214 aa  44.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0941  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 239 aa  45.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  35.24 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1805  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 235 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.604953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0961  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 218 aa  43.9  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4154  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 234 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0726195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1382  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 194 aa  44.3  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  27.78 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4005  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 242 aa  43.9  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2847  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 203 aa  43.5  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02663  transcriptional regulator  26.19 
 
 		 204 aa  43.5  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0806616  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 203 aa  43.5  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2244  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 197 aa  43.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000061933  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0547  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 		 249 aa  42.7  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  39.06 
 
 		 196 aa  42.7  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4018  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 216 aa  43.1  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0066  transcriptional regulator  24.29 
 
 		 193 aa  42.7  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1551  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 227 aa  42.7  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 216 aa  42.4  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3645  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 199 aa  42.4  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.529358  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1646  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 233 aa  42.4  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1304  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 234 aa  42.4  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1639  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 215 aa  42.4  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  31.78 
 
 		 264 aa  42.4  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 219 aa  42.4  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 208 aa  42  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 215 aa  42  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 218 aa  41.6  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>