More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2542 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2542  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 248 aa  501  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2372  regulatory protein, LuxR  69.29 
 
 		 248 aa  301  8.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.125582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3005  two component LuxR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00815247  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2109  LuxR family DNA-binding response regulator  39.56 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2048  response regulator  39.56 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.102554  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2046  response regulator  39.56 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4344  two component LuxR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.218307 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2265  LuxR family DNA-binding response regulator  39.56 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.201191  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2290  DNA-binding response regulator, LuxR family  39.56 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000736213 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02155  putative regulator in two-component regulatory system ; LuxR family protein  49.12 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0508  response regulator receiver protein  49.18 
 
 		 212 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0020  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 229 aa  61.2  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2375  DNA-binding response regulator, LuxR family  43.04 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248491  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4428  two component LuxR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2591  two component LuxR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.211381  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3975  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0482097  normal  0.237128 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1932  two component LuxR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4781  LuxR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0502492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1249  two component LuxR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4255  LuxR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0102406 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3305  LuxR family DNA-binding response regulator  51.85 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2626  two component LuxR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.390788  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3043  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652561  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3078  DNA-binding response regulator, LuxR family  44.62 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000185138 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2245  DNA-binding response regulator, LuxR family  44.62 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0091  regulatory protein LuxR  48.44 
 
 		 410 aa  58.5  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19700  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.95 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3404  transcriptional regulator, LuxR family  45.21 
 
 		 427 aa  58.5  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226025  normal  0.0787607 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5070  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.66 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.744929 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1874  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.18 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.635222  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 208 aa  58.5  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0315  LuxR family DNA-binding response regulator  36.07 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2848  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.37 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0065  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 204 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 213 aa  58.5  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03258  two-component system regulatory protein  48.28 
 
 		 222 aa  58.5  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.31 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.62 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  45.76 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5202  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.78 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677169  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5613  transcriptional regulator, LuxR family  37.23 
 
 		 238 aa  57  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0801  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 227 aa  57  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4078  hypothetical protein  38.37 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0439982  normal  0.0668702 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.28 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0834  LuxR response regulator receiver  30.57 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0179337 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1182  two component LuxR family transcriptional regulator  50.88 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192356 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0945  response regulator receiver  41.77 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0407172  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00712  putative regulator in two-component regulatory system ; LuxR family protein  45.61 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.169527  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0960  two component LuxR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0799  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0967  DNA-binding response regulator  40.62 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.598364  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2354  two component LuxR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.76 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2068  LuxR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 85 aa  55.8  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0760064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1450  two component LuxR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.89 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0522  two component LuxR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0408  two component LuxR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0164  two component LuxR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.523755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3283  two component LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.335218 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0664  two component LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.358413 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.57 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1160  two component LuxR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1537  putative two-component response regulator  47.37 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3229  two component LuxR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0480  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.11 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3716  two component LuxR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.576881  normal  0.099275 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0828  two component LuxR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00513824  normal  0.360671 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2275  LuxR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1981  two component LuxR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.607794  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17670  LuxR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3459  two component LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.306063  normal  0.532773 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1738  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.91 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0459515  normal  0.949758 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7658  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.46 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1563  DNA-binding response regulator  45.76 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000942452  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3849  DNA-binding response regulator  45.76 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000308683  hitchhiker  0.000000000350245 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1348  DNA-binding response regulator  45.76 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000440829  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1321  response regulator  45.76 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000332221  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3480  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.25 
 
 		 210 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.147525 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1363  two component LuxR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0039551  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1531  DNA-binding response regulator  45.76 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.64189e-24 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4565  two component LuxR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1571  XRE family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 227 aa  55.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3598  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.8 
 
 		 218 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329097  normal  0.731815 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0582  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.19 
 
 		 204 aa  55.1  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0273  two component LuxR family transcriptional regulator  50.88 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4024  two component LuxR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 216 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000136895 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0331  LuxR family DNA-binding response regulator  46.15 
 
 		 213 aa  55.1  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.338839  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0920  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.15 
 
 		 225 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491034  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1563  two component LuxR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 257 aa  55.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.781509  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0522  response regulator receiver protein  27.63 
 
 		 223 aa  55.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2218  two component LuxR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 221 aa  54.7  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>