130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2121 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2121  cytochrome B561  100 
 
 		 181 aa  353  1e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0436144  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3088  cytochrome B561  61.93 
 
 		 180 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.76146  normal  0.0516175 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  31.35 
 
 		 187 aa  67.4  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1850  hypothetical protein  51.61 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0857051 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4487  YceI family protein  29.79 
 
 		 441 aa  60.5  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  30.51 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  29.14 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  30.37 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  30.94 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1941  cytochrome B561  31.11 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.273152  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  29.44 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0967  cytochrome B561  28.18 
 
 		 181 aa  55.1  0.0000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5571  putative cytochrome b561  29.05 
 
 		 182 aa  54.3  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2889  cytochrome B561  29.05 
 
 		 183 aa  53.9  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0592122  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1820  cytochrome b561 family protein  25.81 
 
 		 184 aa  53.9  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0593327  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1930  cytochrome B561  25.81 
 
 		 184 aa  53.9  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1513  cytochrome b561  29.55 
 
 		 181 aa  53.1  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.141112 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1272  cytochrome B561  31.15 
 
 		 190 aa  53.1  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.0192884 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0073  cytochrome b561, putative  32.95 
 
 		 175 aa  52.8  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.475436  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3652  putative cytochrome B561  31.52 
 
 		 195 aa  52.4  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0005  cytochrome B561  31.07 
 
 		 177 aa  52.8  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0183044 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4671  cytochrome B561  29.94 
 
 		 178 aa  52.8  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.098632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2223  cytochrome b561 family protein  25.27 
 
 		 184 aa  52.8  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0039455  hitchhiker  0.00454282 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0153  nickel-dependent hydrogenase b- type cytochrome subunit  30.23 
 
 		 173 aa  52  0.000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.520725  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0062  cytochrome B561  31.82 
 
 		 176 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000272347  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0833  cytochrome B561  28.19 
 
 		 192 aa  52.4  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.383328  hitchhiker  0.00227976 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0009  cytochrome B561  31.82 
 
 		 176 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000853372  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3420  cytochrome b561 family protein  31.11 
 
 		 197 aa  52.4  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00251628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1610  cytochrome B561  30.21 
 
 		 176 aa  52  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0980  putative cytochrome b561  24.72 
 
 		 177 aa  51.6  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  33.33 
 
 		 175 aa  51.6  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0603  cytochrome B561  28.43 
 
 		 188 aa  51.6  0.000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0241  cytochrome B561  29.61 
 
 		 195 aa  51.2  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.263387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0030  cytochrome B561  31.82 
 
 		 177 aa  51.2  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000693928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0761  cytochrome B561  27.32 
 
 		 204 aa  51.2  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.599963 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  26.2 
 
 		 184 aa  50.4  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0296  cytochrome B561  33.71 
 
 		 174 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000303628  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  33.71 
 
 		 175 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.083674  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1711  YceI  25.14 
 
 		 420 aa  49.7  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811721  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1464  cytochrome B561  28.95 
 
 		 179 aa  50.1  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2804  cytochrome B561  32.95 
 
 		 177 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.850837  normal  0.374097 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1888  cytochrome B561  28.73 
 
 		 184 aa  50.1  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.743741  hitchhiker  0.000498058 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2184  putative cytochrome B561  28.19 
 
 		 400 aa  50.1  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  28.02 
 
 		 189 aa  49.7  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1056  cytochrome B561  25.83 
 
 		 181 aa  49.3  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.52465  normal  0.404456 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0973  cytochrome b561 family protein  25.73 
 
 		 181 aa  48.9  0.00004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.304775  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2389  cytochrome B561  32.77 
 
 		 177 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1617  hypothetical protein  28.09 
 
 		 176 aa  48.5  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0006  cytochrome B561  30.73 
 
 		 176 aa  48.5  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000161036  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1444  cytochrome B561  26.74 
 
 		 183 aa  48.5  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296577  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7129  putative cytochrome b561  29.65 
 
 		 176 aa  48.5  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  27.43 
 
 		 193 aa  48.5  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2886  cytochrome B561  32.37 
 
 		 177 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0147593  normal  0.995623 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4170  cytochrome B561  30.95 
 
 		 181 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1418  nickel-dependent hydrogenases B-type cytochrome subunit family protein  29.71 
 
 		 171 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1612  hypothetical protein  27.53 
 
 		 176 aa  48.1  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0014  cytochrome B561  31.25 
 
 		 176 aa  48.1  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4984  cytochrome B561  28.57 
 
 		 179 aa  47.8  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0448124 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  26.49 
 
 		 193 aa  47.8  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3195  cytochrome B561  31.07 
 
 		 176 aa  47.8  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000038673  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  24.04 
 
 		 182 aa  47.4  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4656  cytochrome B561  30.34 
 
 		 184 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.282732 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1538  cytochrome B561  33.74 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.757647 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5657  cytochrome B561  30.22 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.998703 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  23.5 
 
 		 182 aa  47  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0932  cytochrome b561 family protein  22.73 
 
 		 173 aa  46.2  0.0002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3459  putative cytochrome B561  27.42 
 
 		 177 aa  46.6  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.422444 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1322  cytochrome B561  25.45 
 
 		 183 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00114864  normal  0.0249294 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3042  cytochrome B561  26.06 
 
 		 183 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000618987  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3234  cytochrome B561  29.61 
 
 		 177 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.730011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3056  cytochrome B561  25.45 
 
 		 183 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000111673  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1120  cytochrome B561  32.8 
 
 		 184 aa  45.8  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000137011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1400  cytochrome B561  30.77 
 
 		 397 aa  46.2  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  27.27 
 
 		 188 aa  46.2  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  29.31 
 
 		 178 aa  45.4  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3290  cytochrome B561  32.95 
 
 		 178 aa  45.1  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.363067  normal  0.604346 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04738  cytochrome b561  26.26 
 
 		 195 aa  45.1  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1661  cytochrome B561  26.14 
 
 		 179 aa  45.1  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.142328  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2745  putative cytochrome B561  26.4 
 
 		 191 aa  45.1  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1225  YceJ  25.52 
 
 		 190 aa  45.1  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.307715  normal  0.414708 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1745  cytochrome B561  27.94 
 
 		 406 aa  45.1  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399847  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2517  cytochrome B561  25.77 
 
 		 184 aa  44.7  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3680  cytochrome B561  28.78 
 
 		 177 aa  44.7  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3199  cytochrome B561  25 
 
 		 183 aa  44.7  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000519809  normal  0.560519 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3806  cytochrome B561  32.95 
 
 		 178 aa  44.7  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.131783  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0781  cytochrome B561  26.2 
 
 		 183 aa  44.3  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.231084  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  28.65 
 
 		 184 aa  43.9  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2450  cytochrome B561  29.78 
 
 		 188 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.220422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3013  cytochrome B561  24.06 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637618 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1178  cytochrome B561  25 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000103692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2703  cytochrome B561  24.86 
 
 		 183 aa  44.3  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100012  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6723  cytochrome B561  27.66 
 
 		 180 aa  43.9  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6306  cytochrome B561  27.33 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2023  cytochrome B561  25.27 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1177  cytochrome B561  25 
 
 		 183 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000321845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3871  putative cytochrome b561  27.18 
 
 		 195 aa  43.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.614366  normal  0.414753 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0072  cytochrome B561  24.12 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5215  cytochrome B561  28.82 
 
 		 174 aa  43.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.721049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  29.38 
 
 		 186 aa  42.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2753  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  23.26 
 
 		 176 aa  42.7  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000856955  normal  0.186819 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>