205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_04738 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_04738  cytochrome b561  100 
 
 		 195 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0135  putative cytochrome b561  53.29 
 
 		 179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.81104  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4238  cytochrome B561  44.89 
 
 		 176 aa  160  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.482827  normal  0.295562 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1444  cytochrome B561  40.91 
 
 		 183 aa  142  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296577  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05609  hypothetical protein  62.26 
 
 		 141 aa  125  5e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  31.43 
 
 		 182 aa  77.4  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  31.43 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1418  nickel-dependent hydrogenases B-type cytochrome subunit family protein  28.14 
 
 		 171 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1661  cytochrome B561  26.32 
 
 		 179 aa  74.3  0.0000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.142328  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  27.51 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  29.65 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1056  cytochrome B561  28.89 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.52465  normal  0.404456 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1272  cytochrome B561  31.25 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.0192884 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2303  cytochrome B561  29.19 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469268  normal  0.0531302 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  30.6 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  30.06 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  27.65 
 
 		 178 aa  67.8  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0603  cytochrome B561  29.14 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  25.58 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0472  putative cytochrome b561  28.57 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  2.73245e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  28.82 
 
 		 184 aa  64.7  0.0000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  29.82 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  30.18 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1906  cytochrome b561 family protein  31.25 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1306  cytochrome B561  32.37 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  28.32 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  26.26 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  28 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  28.16 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1571  cytochrome B561  31.64 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.896883 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  26.73 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  25.84 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  25.56 
 
 		 191 aa  61.2  0.000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0686  cytochrome b561  27.43 
 
 		 188 aa  61.2  0.000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  28.81 
 
 		 173 aa  60.8  0.00000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  25.95 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05500  hypothetical protein  29.55 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2731  cytochrome B561  27.66 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578795  normal  0.080966 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2876  cytochrome B561  27.61 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.379711  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  26.63 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  27.81 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  27.65 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0522  hypothetical protein  29.55 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336315  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0418  cytochrome B561  25.91 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  27.47 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0973  cytochrome b561 family protein  27.01 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.304775  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05925  cytochrome b561  27.75 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000195  cytochrome b561  27.75 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000187144  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0932  cytochrome b561 family protein  26.32 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  26.92 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2061  cytochrome B561  25.62 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2517  cytochrome B561  28.89 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  25.88 
 
 		 190 aa  57.8  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1554  cytochrome B561  28.49 
 
 		 183 aa  57.8  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4982  cytochrome B561  30.29 
 
 		 183 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5285  cytochrome B561  28.89 
 
 		 183 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621373  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4855  cytochrome B561  30.29 
 
 		 183 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2432  cytochrome B561  29.26 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.39215  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  26.54 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0761  cytochrome B561  24.12 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.599963 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  27.43 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2073  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  31.43 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636056  normal  0.331643 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1941  cytochrome B561  27.53 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.273152  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  26.55 
 
 		 178 aa  57  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  27.47 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  26.92 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  22.16 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  28.57 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5356  putative cytochrome b561  27.12 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00398289 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1610  cytochrome B561  29.61 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.726643  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0098  putative cytochrome B561  27.01 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  25.27 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1610  cytochrome B561  26.38 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  25.27 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6306  cytochrome B561  28.16 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4169  cytochrome B561  27.33 
 
 		 185 aa  54.7  0.0000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0139606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1436  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  30.29 
 
 		 188 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.887549  normal  0.160518 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2543  cytochrome B561  30.29 
 
 		 188 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.210551  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  25.27 
 
 		 186 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2271  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  30.29 
 
 		 188 aa  53.9  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1179  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  30.29 
 
 		 188 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1180  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  30.29 
 
 		 188 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  28 
 
 		 183 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1888  cytochrome B561  27.17 
 
 		 184 aa  54.3  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.743741  hitchhiker  0.000498058 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  26.04 
 
 		 193 aa  53.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0967  cytochrome B561  31.21 
 
 		 181 aa  53.5  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1225  YceJ  28.74 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.307715  normal  0.414708 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  25 
 
 		 185 aa  53.9  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01053  predicted cytochrome b561  29.71 
 
 		 188 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.580116  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2589  cytochrome B561  29.71 
 
 		 188 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.806134  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0781  cytochrome B561  26.37 
 
 		 183 aa  53.1  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.231084  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2889  cytochrome B561  27.59 
 
 		 183 aa  52.8  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0592122  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  24.87 
 
 		 193 aa  53.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01061  hypothetical protein  29.71 
 
 		 188 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2703  cytochrome B561  23.64 
 
 		 183 aa  53.1  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100012  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3505  cytochrome b561, putative  25.82 
 
 		 179 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  26.16 
 
 		 188 aa  52.4  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1049  cytochrome B561  29.63 
 
 		 410 aa  52.4  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.183438  normal  0.102385 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1714  cytochrome B561  25.29 
 
 		 182 aa  52  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00452879  normal  0.140891 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3599  cytochrome b561 family protein  29.73 
 
 		 189 aa  51.6  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.206371  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>