More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0670 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0670  ABC transporter related  100 
 
 
246 aa  501  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.872821  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3548  L-cystine import ATP-binding protein TcyN  51.88 
 
 
253 aa  270  2e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.159589  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2349  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.05 
 
 
245 aa  269  2.9999999999999997e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.271296  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3546  amino acid ABC transporter-like protein  51.88 
 
 
253 aa  268  4e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2061  glutamine transport protein glnQ  50.63 
 
 
245 aa  267  1e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3234  ABC transporter related  51.05 
 
 
265 aa  265  7e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0738918  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0689  ABC transporter-related protein  51.04 
 
 
244 aa  264  1e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.127934  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0761  ABC transporter related  51.67 
 
 
244 aa  263  2e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0947  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.25 
 
 
244 aa  262  4e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0910  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.25 
 
 
244 aa  262  4e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0949  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.25 
 
 
244 aa  261  6e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1037  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.83 
 
 
244 aa  260  1e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0755  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.83 
 
 
244 aa  260  1e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4428  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.42 
 
 
244 aa  260  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177089  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0762  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.83 
 
 
244 aa  260  2e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0814  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.42 
 
 
244 aa  256  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0857  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.42 
 
 
244 aa  256  2e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  51.04 
 
 
244 aa  256  2e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2511  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.5 
 
 
245 aa  255  4e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000409098  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  50.42 
 
 
244 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0374  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  48.54 
 
 
257 aa  254  1.0000000000000001e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.293894  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  50.63 
 
 
240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  47.3 
 
 
244 aa  252  4.0000000000000004e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0371  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  48.75 
 
 
245 aa  251  7e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2298  ABC transporter related  50.21 
 
 
247 aa  250  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000478919  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  47.39 
 
 
263 aa  249  2e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2233  ABC transporter related  48.95 
 
 
246 aa  250  2e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.693391  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  50.42 
 
 
246 aa  249  3e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2653  polar amino acid ABC transporter ATPase  47.15 
 
 
267 aa  249  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5173  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  49.79 
 
 
261 aa  249  3e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.569594  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1260  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein  51.24 
 
 
252 aa  249  3e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498461  normal  0.0306795 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002012  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  47.92 
 
 
245 aa  249  4e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000066278  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1617  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  46.47 
 
 
247 aa  248  4e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000736916  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2730  ABC-type histidine transport system, ATPase component  49.6 
 
 
264 aa  248  5e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2789  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  49.6 
 
 
264 aa  248  5e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.782335  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3089  ABC transporter-like  50 
 
 
265 aa  248  5e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.280473  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3973  ABC transporter related  48.37 
 
 
282 aa  248  7e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2429  putative arginine/ornithine ABC transporter, ATP-binding protein  49.19 
 
 
264 aa  247  1e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.795257  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1739  putative arginine/ornithine ABC transporter, ATP-binding protein  49.19 
 
 
264 aa  247  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209767  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2862  putative arginine/ornithine ABC transporter, ATP-binding protein  49.19 
 
 
264 aa  247  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0589  arginine/ornithine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  49.19 
 
 
264 aa  247  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2851  histidine transport ATP-binding protein  49.19 
 
 
264 aa  247  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7501  ABC transporter related  48.39 
 
 
273 aa  247  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03640  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.12 
 
 
245 aa  247  1e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0883  ABC transporter related  50.4 
 
 
259 aa  247  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.741184 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  47.08 
 
 
239 aa  246  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0887  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.8 
 
 
255 aa  246  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1773  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.6 
 
 
264 aa  246  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0968  ABC transporter related  49.6 
 
 
256 aa  246  2e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212738  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3633  ABC transporter related  49.19 
 
 
263 aa  246  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0354242 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  50 
 
 
246 aa  247  2e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1231  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.77 
 
 
242 aa  247  2e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  50.42 
 
 
263 aa  246  3e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  48.75 
 
 
244 aa  246  3e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  49.37 
 
 
243 aa  245  4e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2485  ABC transporter related  48.75 
 
 
243 aa  245  4e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  49.58 
 
 
249 aa  245  4e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2437  ABC transporter related  48.75 
 
 
243 aa  245  4e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0185  ABC transporter related  47.92 
 
 
243 aa  245  4e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0631734 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  48.12 
 
 
253 aa  245  4.9999999999999997e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0006  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein  45.83 
 
 
245 aa  245  4.9999999999999997e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00283619  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0494  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  50.21 
 
 
242 aa  245  4.9999999999999997e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1245  histidine transport ATP-binding protein  48.79 
 
 
255 aa  244  8e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.271507  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1087  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  48.79 
 
 
255 aa  244  8e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.251068  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1092  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  48.79 
 
 
255 aa  244  8e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195395  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0139  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  45.83 
 
 
260 aa  244  8e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0490  ABC transporter related  47.72 
 
 
241 aa  244  9e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11340  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.32 
 
 
258 aa  244  9e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.571361  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3015  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.79 
 
 
255 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0526452  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0744  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.79 
 
 
255 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.130821  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18750  ABC transporter related  49.38 
 
 
250 aa  244  9.999999999999999e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000378719  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1582  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.79 
 
 
255 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0189341  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1789  ABC transporter related  47.98 
 
 
263 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767906  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0849  ABC transporter related  47.3 
 
 
247 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000288361  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1918  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  47.7 
 
 
255 aa  244  9.999999999999999e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.248915  hitchhiker  0.0037294 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1152  ABC transporter related  47.33 
 
 
247 aa  244  9.999999999999999e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.645905  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0959  ABC transporter related  48.76 
 
 
260 aa  243  9.999999999999999e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0598  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.33 
 
 
242 aa  243  9.999999999999999e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00132309  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0985  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.79 
 
 
255 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78834  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4634  ABC transporter related  46.37 
 
 
263 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2834  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  50.4 
 
 
268 aa  243  1.9999999999999999e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.341986  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1231  ABC transporter related  51.05 
 
 
252 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.903047  normal  0.0835348 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2127  ABC transporter related  50.63 
 
 
264 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0039  ABC transporter related  49.79 
 
 
256 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  47.08 
 
 
240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  48.54 
 
 
244 aa  243  1.9999999999999999e-63  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6988  ABC transporter related  48.79 
 
 
265 aa  243  3e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.741907  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1438  ABC transporter related  48.54 
 
 
243 aa  243  3e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0239  ABC transporter related  47.08 
 
 
256 aa  243  3e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  48.95 
 
 
247 aa  242  3e-63  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  48.55 
 
 
242 aa  242  3e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1556  ABC transporter related  47.18 
 
 
263 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648429  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0101  ABC transporter related protein  47.81 
 
 
262 aa  242  3.9999999999999997e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  48.55 
 
 
244 aa  242  3.9999999999999997e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  47.08 
 
 
244 aa  242  3.9999999999999997e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5734  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  49.19 
 
 
259 aa  242  5e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.791565  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1160  polar amino acid ABC transporter ATPase  47.77 
 
 
254 aa  241  5e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236932  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00439  ABC polar amino acid transporter ATPase component  45.83 
 
 
245 aa  242  5e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4555  ABC transporter related  47.76 
 
 
299 aa  241  6e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2411  ABC transporter related  49.6 
 
 
259 aa  241  6e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00777429 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>