More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3726 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3726  D-amino acid dehydrogenase small subunit  100 
 
 		 416 aa  856    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4307  D-amino acid dehydrogenase small subunit  71.23 
 
 		 417 aa  629  1e-179  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4417  D-amino acid dehydrogenase small subunit  71.23 
 
 		 417 aa  629  1e-179  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0828859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1542  D-amino acid dehydrogenase small subunit  65.06 
 
 		 420 aa  545  1e-154  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.224585  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1348  D-amino acid dehydrogenase small subunit  64.91 
 
 		 403 aa  534  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0107564  normal  0.0434292 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5580  D-amino acid dehydrogenase small subunit  63.17 
 
 		 422 aa  529  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0404  D-amino acid dehydrogenase small subunit  66.67 
 
 		 409 aa  526  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4194  D-amino acid dehydrogenase small subunit  62.2 
 
 		 419 aa  511  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1124  D-amino acid dehydrogenase small subunit  61.8 
 
 		 411 aa  495  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.548821 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0183  D-amino acid dehydrogenase small subunit  58.29 
 
 		 433 aa  462  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.618165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1408  D-amino-acid dehydrogenase  39.62 
 
 		 422 aa  276  5e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2864  D-amino-acid dehydrogenase  36.73 
 
 		 417 aa  265  1e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.30815  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0168  D-amino-acid dehydrogenase  35.19 
 
 		 439 aa  251  2e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4507  D-amino acid dehydrogenase small subunit  37 
 
 		 439 aa  250  4e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251273 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0751  D-amino-acid dehydrogenase  36.82 
 
 		 433 aa  250  4e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0158  D-amino acid dehydrogenase subunit  35.01 
 
 		 443 aa  248  1e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000347437 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3842  D-amino acid dehydrogenase small subunit  37.56 
 
 		 418 aa  248  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0528  D-amino-acid dehydrogenase  37.77 
 
 		 443 aa  247  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0091768  hitchhiker  0.00000110387 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1444  D-amino acid dehydrogenase small subunit  36.9 
 
 		 416 aa  248  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.492956  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4777  D-amino acid dehydrogenase small subunit  36.36 
 
 		 416 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.565064  normal  0.111911 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2082  D-amino-acid dehydrogenase  34.69 
 
 		 418 aa  243  3.9999999999999997e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0152588  normal  0.581205 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2380  D-amino-acid dehydrogenase  35.81 
 
 		 428 aa  243  6e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3159  D-amino-acid dehydrogenase  37.05 
 
 		 436 aa  243  6e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3886  D-amino-acid dehydrogenase  36.82 
 
 		 436 aa  241  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.694538 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1318  D-amino acid dehydrogenase small subunit  36.43 
 
 		 419 aa  241  1e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5009  D-amino-acid dehydrogenase  34.88 
 
 		 448 aa  238  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.435309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2093  D-amino acid dehydrogenase small subunit  36.71 
 
 		 416 aa  238  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.59754  normal  0.0350619 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4821  D-amino-acid dehydrogenase  36.04 
 
 		 419 aa  236  4e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052408 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3630  D-amino-acid dehydrogenase  34.3 
 
 		 417 aa  236  4e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000258766 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0866  D-amino acid dehydrogenase small subunit  36.3 
 
 		 416 aa  236  5.0000000000000005e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0290796  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0148  D-amino-acid dehydrogenase  35.65 
 
 		 445 aa  236  7e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.739629  normal  0.382397 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3659  FAD dependent oxidoreductase  35.65 
 
 		 423 aa  236  8e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0804  D-amino acid dehydrogenase small subunit  35.08 
 
 		 433 aa  235  1.0000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452249  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0924  D-amino acid dehydrogenase small subunit  36.3 
 
 		 416 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0948  D-amino-acid dehydrogenase  34.66 
 
 		 435 aa  233  6e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4831  D-amino acid dehydrogenase small subunit  35.41 
 
 		 416 aa  232  9e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0419861  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3520  D-amino-acid dehydrogenase  34.99 
 
 		 444 aa  228  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.553559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0094  D-amino-acid dehydrogenase  32.57 
 
 		 455 aa  224  1e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.79359 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0090  D-amino-acid dehydrogenase  33.8 
 
 		 446 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0071  D-amino-acid dehydrogenase  33.8 
 
 		 454 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0808  D-amino acid dehydrogenase small subunit  36.04 
 
 		 416 aa  223  6e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0131  D-amino-acid dehydrogenase  33.26 
 
 		 444 aa  222  9e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.814059  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1301  D-amino acid dehydrogenase small subunit  35.41 
 
 		 418 aa  222  9.999999999999999e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2304  D-amino-acid dehydrogenase  35.24 
 
 		 421 aa  222  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.018021 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3994  D-amino acid dehydrogenase small subunit  34.68 
 
 		 441 aa  219  7.999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1023  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.97 
 
 		 428 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2107  D-amino acid dehydrogenase small subunit  34.93 
 
 		 434 aa  218  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.625399  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0886  FAD dependent oxidoreductase  37.47 
 
 		 439 aa  218  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204512 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2240  D-amino acid dehydrogenase small subunit  34.45 
 
 		 428 aa  218  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1997  D-amino acid dehydrogenase small subunit  34.93 
 
 		 434 aa  218  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.990336  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0585  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.97 
 
 		 428 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2361  D-amino acid dehydrogenase small subunit  34.93 
 
 		 434 aa  218  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0438978  normal  0.320379 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1064  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.97 
 
 		 428 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2122  D-amino-acid dehydrogenase  36.12 
 
 		 421 aa  216  5e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17481  normal  0.029766 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6079  D-amino acid dehydrogenase small subunit  34.22 
 
 		 421 aa  216  5e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2925  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.89 
 
 		 428 aa  216  7e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2974  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.89 
 
 		 428 aa  216  7e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4434  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.82 
 
 		 432 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.615719  hitchhiker  0.00000811455 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1981  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.78 
 
 		 416 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.200719  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0408  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.73 
 
 		 428 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2551  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.73 
 
 		 428 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0222  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.73 
 
 		 428 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2864  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.73 
 
 		 428 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.367842  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0927  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.73 
 
 		 428 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4178  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.81 
 
 		 428 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0740  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.94 
 
 		 434 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.968608  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3967  D-amino acid dehydrogenase small subunit  34.61 
 
 		 433 aa  213  4.9999999999999996e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.194472  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47980  D-amino acid dehydrogenase small subunit  34.92 
 
 		 432 aa  213  4.9999999999999996e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1001  D-amino acid dehydrogenase small subunit  34.15 
 
 		 429 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.835424 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1094  FAD dependent oxidoreductase  36.03 
 
 		 421 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.293126  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3117  D-amino acid dehydrogenase small subunit  35.65 
 
 		 432 aa  212  9e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2746  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.1 
 
 		 434 aa  212  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0984937  decreased coverage  0.0000603863 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2982  D-amino acid dehydrogenase small subunit  34.15 
 
 		 428 aa  212  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00652065 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1546  FAD dependent oxidoreductase  35.24 
 
 		 419 aa  211  2e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1656  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.49 
 
 		 428 aa  211  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0765  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.91 
 
 		 428 aa  209  6e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.555163 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1957  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.73 
 
 		 417 aa  208  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2253  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.57 
 
 		 417 aa  207  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.299864  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0313  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.45 
 
 		 421 aa  208  2e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2547  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.54 
 
 		 434 aa  207  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3174  FAD dependent oxidoreductase  32.94 
 
 		 418 aa  206  5e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0673  D-amino-acid dehydrogenase  33.02 
 
 		 417 aa  206  6e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180164  hitchhiker  0.00553067 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3113  D-amino acid dehydrogenase small subunit  36.41 
 
 		 436 aa  206  9e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2000  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.65 
 
 		 435 aa  205  1e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.881788  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0944  D-amino acid dehydrogenase small subunit  34.07 
 
 		 428 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.972933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3842  D-amino acid dehydrogenase small subunit  36.41 
 
 		 436 aa  205  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.190955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6239  FAD dependent oxidoreductase  32.85 
 
 		 414 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0558  D-amino-acid dehydrogenase small subunit  32.08 
 
 		 419 aa  204  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0791  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.33 
 
 		 417 aa  204  2e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000194872 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6408  FAD dependent oxidoreductase  32.85 
 
 		 414 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.874497  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0940  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.82 
 
 		 428 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6641  FAD dependent oxidoreductase  32.85 
 
 		 414 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3394  FAD dependent oxidoreductase  32.37 
 
 		 414 aa  204  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.361362 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1503  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.18 
 
 		 425 aa  203  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.839298  normal  0.265321 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4473  D-amino-acid dehydrogenase  33.18 
 
 		 417 aa  202  7e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0796  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.22 
 
 		 429 aa  202  8e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.661102  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0867  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.22 
 
 		 429 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.872467  normal  0.695937 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1924  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.17 
 
 		 435 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.385338  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4708  D-amino-acid dehydrogenase  34.22 
 
 		 416 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0268741 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2389  D-amino-acid dehydrogenase  32.29 
 
 		 439 aa  200  3e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>