More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0404 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0404  D-amino acid dehydrogenase small subunit  100 
 
 		 409 aa  833    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1348  D-amino acid dehydrogenase small subunit  68.11 
 
 		 403 aa  551  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0107564  normal  0.0434292 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4417  D-amino acid dehydrogenase small subunit  63.7 
 
 		 417 aa  537  1e-151  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0828859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3726  D-amino acid dehydrogenase small subunit  65.78 
 
 		 416 aa  535  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4307  D-amino acid dehydrogenase small subunit  63.7 
 
 		 417 aa  537  1e-151  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1542  D-amino acid dehydrogenase small subunit  64.95 
 
 		 420 aa  519  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.224585  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4194  D-amino acid dehydrogenase small subunit  61.92 
 
 		 419 aa  512  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5580  D-amino acid dehydrogenase small subunit  62.78 
 
 		 422 aa  510  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1124  D-amino acid dehydrogenase small subunit  59.95 
 
 		 411 aa  484  1e-136  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.548821 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0183  D-amino acid dehydrogenase small subunit  59.46 
 
 		 433 aa  462  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.618165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1408  D-amino-acid dehydrogenase  42.47 
 
 		 422 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3842  D-amino acid dehydrogenase small subunit  41.65 
 
 		 418 aa  263  4e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2864  D-amino-acid dehydrogenase  37.71 
 
 		 417 aa  263  4.999999999999999e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.30815  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0158  D-amino acid dehydrogenase subunit  36.24 
 
 		 443 aa  258  2e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000347437 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0751  D-amino-acid dehydrogenase  37.38 
 
 		 433 aa  258  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2380  D-amino-acid dehydrogenase  37.44 
 
 		 428 aa  254  2.0000000000000002e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0168  D-amino-acid dehydrogenase  36.28 
 
 		 439 aa  252  8.000000000000001e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4507  D-amino acid dehydrogenase small subunit  37.04 
 
 		 439 aa  251  2e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251273 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2093  D-amino acid dehydrogenase small subunit  38.88 
 
 		 416 aa  247  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.59754  normal  0.0350619 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4831  D-amino acid dehydrogenase small subunit  38.1 
 
 		 416 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0419861  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47980  D-amino acid dehydrogenase small subunit  37.62 
 
 		 432 aa  244  9.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1444  D-amino acid dehydrogenase small subunit  36.8 
 
 		 416 aa  244  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.492956  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1546  FAD dependent oxidoreductase  39.04 
 
 		 419 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5009  D-amino-acid dehydrogenase  35.81 
 
 		 448 aa  244  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.435309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0808  D-amino acid dehydrogenase small subunit  38.01 
 
 		 416 aa  242  7.999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3967  D-amino acid dehydrogenase small subunit  36.98 
 
 		 433 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.194472  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4777  D-amino acid dehydrogenase small subunit  38.04 
 
 		 416 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.565064  normal  0.111911 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0528  D-amino-acid dehydrogenase  36.98 
 
 		 443 aa  241  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0091768  hitchhiker  0.00000110387 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2240  D-amino acid dehydrogenase small subunit  38.01 
 
 		 428 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0804  D-amino acid dehydrogenase small subunit  36.41 
 
 		 433 aa  240  4e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3630  D-amino-acid dehydrogenase  35.4 
 
 		 417 aa  237  3e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000258766 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1023  D-amino acid dehydrogenase small subunit  37.53 
 
 		 428 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3159  D-amino-acid dehydrogenase  37.11 
 
 		 436 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0585  D-amino acid dehydrogenase small subunit  37.53 
 
 		 428 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2746  D-amino acid dehydrogenase small subunit  34.93 
 
 		 434 aa  236  5.0000000000000005e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0984937  decreased coverage  0.0000603863 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1064  D-amino acid dehydrogenase small subunit  37.53 
 
 		 428 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0148  D-amino-acid dehydrogenase  35.51 
 
 		 445 aa  236  6e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.739629  normal  0.382397 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0408  D-amino acid dehydrogenase small subunit  37.5 
 
 		 428 aa  236  7e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0222  D-amino acid dehydrogenase small subunit  37.5 
 
 		 428 aa  236  7e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4178  D-amino acid dehydrogenase small subunit  37.05 
 
 		 428 aa  236  7e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2864  D-amino acid dehydrogenase small subunit  37.5 
 
 		 428 aa  236  7e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.367842  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2551  D-amino acid dehydrogenase small subunit  37.5 
 
 		 428 aa  236  7e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0927  D-amino acid dehydrogenase small subunit  37.5 
 
 		 428 aa  236  7e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1001  D-amino acid dehydrogenase small subunit  39.05 
 
 		 429 aa  236  7e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.835424 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3886  D-amino-acid dehydrogenase  36.87 
 
 		 436 aa  235  9e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.694538 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2304  D-amino-acid dehydrogenase  36.41 
 
 		 421 aa  235  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.018021 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2974  D-amino acid dehydrogenase small subunit  37.35 
 
 		 428 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4229  D-amino-acid dehydrogenase  37.77 
 
 		 415 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.825619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2982  D-amino acid dehydrogenase small subunit  38.81 
 
 		 428 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00652065 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2925  D-amino acid dehydrogenase small subunit  37.35 
 
 		 428 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0866  D-amino acid dehydrogenase small subunit  35.63 
 
 		 416 aa  233  4.0000000000000004e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0290796  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1318  D-amino acid dehydrogenase small subunit  36.93 
 
 		 419 aa  233  5e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0740  D-amino acid dehydrogenase small subunit  36.36 
 
 		 434 aa  233  5e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.968608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1656  D-amino acid dehydrogenase small subunit  37.26 
 
 		 428 aa  232  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0924  D-amino acid dehydrogenase small subunit  35.38 
 
 		 416 aa  231  2e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4821  D-amino-acid dehydrogenase  37.47 
 
 		 419 aa  231  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052408 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2547  D-amino acid dehydrogenase small subunit  36.28 
 
 		 434 aa  230  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1981  D-amino acid dehydrogenase small subunit  34.79 
 
 		 416 aa  229  7e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.200719  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0313  D-amino acid dehydrogenase small subunit  34.22 
 
 		 421 aa  228  1e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2000  D-amino acid dehydrogenase small subunit  36.47 
 
 		 435 aa  228  1e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.881788  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6079  D-amino acid dehydrogenase small subunit  36.71 
 
 		 421 aa  228  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2107  D-amino acid dehydrogenase small subunit  35.42 
 
 		 434 aa  228  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.625399  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2361  D-amino acid dehydrogenase small subunit  35.42 
 
 		 434 aa  227  2e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0438978  normal  0.320379 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1997  D-amino acid dehydrogenase small subunit  35.42 
 
 		 434 aa  227  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.990336  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2082  D-amino-acid dehydrogenase  32.52 
 
 		 418 aa  227  4e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0152588  normal  0.581205 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1813  FAD dependent oxidoreductase  34.71 
 
 		 417 aa  227  4e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004326  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.2 
 
 		 418 aa  226  5.0000000000000005e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0940  D-amino acid dehydrogenase small subunit  38 
 
 		 428 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0944  D-amino acid dehydrogenase small subunit  38 
 
 		 428 aa  226  6e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.972933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0765  D-amino acid dehydrogenase small subunit  37.81 
 
 		 428 aa  225  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.555163 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0948  D-amino-acid dehydrogenase  35.01 
 
 		 435 aa  224  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0071  D-amino-acid dehydrogenase  34.35 
 
 		 454 aa  224  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3117  D-amino acid dehydrogenase small subunit  35.99 
 
 		 432 aa  224  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0131  D-amino-acid dehydrogenase  33.88 
 
 		 444 aa  223  3e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.814059  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1924  D-amino acid dehydrogenase small subunit  35.68 
 
 		 435 aa  223  4e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.385338  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2005  D-amino acid dehydrogenase small subunit  35.1 
 
 		 416 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143364  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0791  D-amino acid dehydrogenase small subunit  35.54 
 
 		 417 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000194872 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0094  D-amino-acid dehydrogenase  34.02 
 
 		 455 aa  223  6e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.79359 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0090  D-amino-acid dehydrogenase  34.11 
 
 		 446 aa  222  7e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2253  D-amino acid dehydrogenase small subunit  34.22 
 
 		 417 aa  222  8e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.299864  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1094  FAD dependent oxidoreductase  37.09 
 
 		 421 aa  222  9e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.293126  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4434  D-amino acid dehydrogenase small subunit  34.46 
 
 		 432 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.615719  hitchhiker  0.00000811455 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4708  D-amino-acid dehydrogenase  36.71 
 
 		 416 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0268741 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0926  D-amino acid dehydrogenase small subunit  36.39 
 
 		 429 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.531144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2389  D-amino-acid dehydrogenase  35.05 
 
 		 439 aa  222  9.999999999999999e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1957  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.98 
 
 		 417 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0558  D-amino-acid dehydrogenase small subunit  34.77 
 
 		 419 aa  221  3e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3520  D-amino-acid dehydrogenase  34.51 
 
 		 444 aa  219  7e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.553559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1301  D-amino acid dehydrogenase small subunit  36.17 
 
 		 418 aa  219  7e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0444  D-amino-acid dehydrogenase  34.79 
 
 		 434 aa  219  7.999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3174  FAD dependent oxidoreductase  34.14 
 
 		 418 aa  216  5e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3842  D-amino acid dehydrogenase small subunit  38.48 
 
 		 436 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.190955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0867  D-amino acid dehydrogenase small subunit  34.7 
 
 		 429 aa  215  9e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.872467  normal  0.695937 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5270  D-amino acid dehydrogenase small subunit  34.7 
 
 		 434 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0829502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5526  D-amino acid dehydrogenase small subunit  34.7 
 
 		 434 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3113  D-amino acid dehydrogenase small subunit  38.99 
 
 		 436 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2122  D-amino-acid dehydrogenase  37.16 
 
 		 421 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17481  normal  0.029766 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0886  FAD dependent oxidoreductase  36.02 
 
 		 439 aa  214  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204512 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5180  D-amino acid dehydrogenase small subunit  34.7 
 
 		 434 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0763537 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5322  D-amino acid dehydrogenase small subunit  34.7 
 
 		 434 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116126 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>