More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3964 on replicon NC_007488
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007488  RSP_3964  ABC branched chain amino acid transporter, ATPase subunit  100 
 
 
235 aa  473  1e-133  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.835609  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0225  ABC transporter related  47.35 
 
 
237 aa  213  9.999999999999999e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.633175  normal  0.041415 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4464  ABC transporter related  43.59 
 
 
237 aa  206  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335127  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0660  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.59 
 
 
237 aa  206  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4329  ABC transporter related  43.16 
 
 
237 aa  202  5e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.23 
 
 
231 aa  201  7e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  47.03 
 
 
233 aa  201  8e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  47.03 
 
 
233 aa  201  8e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  46.81 
 
 
231 aa  201  9e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  46.81 
 
 
231 aa  201  9e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0990  ABC transporter related  45.98 
 
 
230 aa  200  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.39491  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.99 
 
 
233 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0956  ABC transporter-related protein  45.98 
 
 
230 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.187154  normal  0.0788319 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1177  ABC transporter related  46.35 
 
 
236 aa  199  3e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.496575  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  47.03 
 
 
233 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1957  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.31 
 
 
231 aa  198  7e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1259  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.48 
 
 
237 aa  198  7e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.575608 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3554  ABC transporter related  45.96 
 
 
234 aa  197  7.999999999999999e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.256863  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1660  ABC transporter related  43.22 
 
 
234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1500  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.59 
 
 
230 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.456075  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3423  ABC transporter related  44.02 
 
 
237 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4188  ABC transporter related  43.59 
 
 
231 aa  196  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  45.06 
 
 
231 aa  196  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1446  ABC transporter related  45.96 
 
 
234 aa  196  3e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0771597  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1284  ABC transporter related  45.96 
 
 
234 aa  196  3e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.275207  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2189  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  44.64 
 
 
230 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.113026 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1866  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  44.64 
 
 
230 aa  195  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.357667 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  45.15 
 
 
233 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2431  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding proteinputative  42.06 
 
 
234 aa  195  5.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  43.78 
 
 
235 aa  195  6e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3207  ABC transporter related  43.69 
 
 
230 aa  194  7e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.973641  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  45.53 
 
 
232 aa  194  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0950  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  42.86 
 
 
230 aa  194  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0794  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  45.5 
 
 
230 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3687  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  42.86 
 
 
230 aa  193  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.137759 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0783  ABC transporter related  45.5 
 
 
230 aa  193  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  43.98 
 
 
236 aa  193  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4218  ABC transporter related  41.2 
 
 
234 aa  193  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.110724 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4793  ABC transporter related  44.87 
 
 
233 aa  193  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.262545  normal  0.126622 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3131  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.14 
 
 
230 aa  192  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1979  ABC transporter related  43.59 
 
 
236 aa  192  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3071  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.14 
 
 
230 aa  192  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.664903  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  43.57 
 
 
236 aa  192  3e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3107  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.14 
 
 
230 aa  192  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.168461  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  43.88 
 
 
234 aa  192  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3686  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  42.54 
 
 
248 aa  192  4e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0747254  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  47.03 
 
 
234 aa  192  5e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0427  ABC transporter related  44.2 
 
 
230 aa  191  6e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3377  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  42.54 
 
 
248 aa  191  6e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0906  ABC transporter related  44.2 
 
 
230 aa  191  6e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2255  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  43.1 
 
 
230 aa  191  7e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255025  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1244  ABC transporter related  42.74 
 
 
236 aa  191  9e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193229  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2037  ABC transporter ATP-binding protein  42.86 
 
 
230 aa  191  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.221876 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0186  ABC transporter related  41.84 
 
 
244 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0876  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  44.2 
 
 
230 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3568  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  42.11 
 
 
250 aa  191  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.895169  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1002  ABC transporter related  44.12 
 
 
238 aa  190  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1198  ABC transporter related  43.69 
 
 
230 aa  190  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0175131  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0728  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.69 
 
 
230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1447  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  42.11 
 
 
229 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.912027  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2180  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.69 
 
 
230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.701508  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2052  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.69 
 
 
230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2561  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.69 
 
 
230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.371156  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3860  ABC transporter related  44.6 
 
 
229 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  44.49 
 
 
235 aa  189  4e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2486  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  44.59 
 
 
230 aa  189  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1099  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  42.79 
 
 
231 aa  189  5e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.810395  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3676  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  44.02 
 
 
234 aa  188  7e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399578  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  41.81 
 
 
233 aa  188  7e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1256  ABC transporter related  41.23 
 
 
229 aa  188  8e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.157186 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0545  ABC transporter related  45.11 
 
 
234 aa  188  8e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.756199 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4010  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.69 
 
 
235 aa  187  9e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00833524  normal  0.256095 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1425  ABC transporter-related protein  43.36 
 
 
232 aa  187  9e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3489  ABC transporter  41.03 
 
 
231 aa  187  9e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0701  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.52 
 
 
230 aa  187  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.944292  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2309  ABC transporter related  43.98 
 
 
236 aa  187  1e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2201  ABC transporter  42.54 
 
 
229 aa  186  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0824308  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3863  ABC transporter related  43.56 
 
 
229 aa  186  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.870749  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2256  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  42.73 
 
 
250 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3935  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  43.3 
 
 
230 aa  186  4e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  45.15 
 
 
237 aa  185  4e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3377  ABC transporter related  41.52 
 
 
232 aa  186  4e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  45.15 
 
 
237 aa  185  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  39.66 
 
 
247 aa  185  5e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0658  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.19 
 
 
229 aa  185  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.350173 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1397  ABC transporter related  40.62 
 
 
230 aa  185  6e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427343  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0597  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  42.11 
 
 
252 aa  185  6e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0909896  normal  0.0238528 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4365  ABC transporter-like  43.42 
 
 
232 aa  184  7e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1088  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  41.52 
 
 
230 aa  184  7e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  39.66 
 
 
247 aa  184  8e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3314  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  41.88 
 
 
231 aa  184  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2414  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.67 
 
 
229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.765839  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0586  ABC transporter-like  42.04 
 
 
232 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4061  ABC transporter related  41 
 
 
252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.245646 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0192  ABC transporter related  42.11 
 
 
229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  40.25 
 
 
235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0355  ABC transporter related  42.49 
 
 
234 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0980  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  41.44 
 
 
229 aa  182  3e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.169161  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5672  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  42.41 
 
 
229 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4632  ABC transporter related  42.41 
 
 
229 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.267394  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>