More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0315 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0315  biotin-(acetyl CoA carboxylase) holoenzyme synthetase  100 
 
 
324 aa  666    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0346  biotin/lipoate A/B protein ligase  87.04 
 
 
320 aa  572  1.0000000000000001e-162  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0465  biotin/lipoate A/B protein ligase  38.68 
 
 
354 aa  191  1e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0227  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.72 
 
 
262 aa  91.3  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00038256 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0142  biotin--protein ligase  28.37 
 
 
319 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.330287  normal  0.0344662 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3396  biotin--protein ligase  28.43 
 
 
319 aa  82  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.199101  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0327  biotin--protein ligase  28.43 
 
 
319 aa  82  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0364706  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3871  biotin--protein ligase  28.43 
 
 
319 aa  82  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000364778  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3965  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.74 
 
 
308 aa  80.9  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.89958  normal  0.0374002 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0847  biotin-[acetylCoA carboxylase] holoenzyme synthetase and biotin operon repressor  26.57 
 
 
331 aa  79  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0822  biotin-[acetylCoA carboxylase] holoenzyme synthetase and biotin operon repressor  26.84 
 
 
333 aa  79  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3740  biotin--protein ligase  29.76 
 
 
319 aa  77.8  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00032759  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0406  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  29.62 
 
 
326 aa  76.3  0.0000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.617579  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4716  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  29.72 
 
 
292 aa  73.9  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.492677  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4349  biotin--protein ligase  29.7 
 
 
320 aa  73.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000983671  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4471  biotin--protein ligase  29.7 
 
 
320 aa  73.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000340796  hitchhiker  0.00000000000240151 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4546  biotin--protein ligase  29.7 
 
 
320 aa  73.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000449604  hitchhiker  0.00000000138084 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4381  biotin--protein ligase  29.7 
 
 
320 aa  73.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4468  biotin--protein ligase  29.7 
 
 
320 aa  73.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0221784  hitchhiker  0.00169649 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4174  biotin--protein ligase  28.36 
 
 
319 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000228488  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0184  biotin--protein ligase  28.36 
 
 
319 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.570128  hitchhiker  0.00065537 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0180  biotin--protein ligase  28.36 
 
 
319 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0210584  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04301  putative biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  27.8 
 
 
252 aa  72.8  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0201  biotin--protein ligase  28.39 
 
 
319 aa  72.8  0.000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.286867  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2717  biotin--protein ligase  27.31 
 
 
320 aa  72.8  0.000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000120108  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03854  biotin-protein ligase  29.7 
 
 
321 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0188201  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4017  bifunctional BirA, biotin operon repressor/biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.19 
 
 
321 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0118949  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4047  biotin--protein ligase  29.7 
 
 
321 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0641292  hitchhiker  0.00297103 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5438  biotin--protein ligase  29.7 
 
 
321 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000183056  hitchhiker  0.00134266 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4421  biotin--protein ligase  29.7 
 
 
321 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000434302  hitchhiker  0.00072275 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4461  biotin--protein ligase  29.7 
 
 
321 aa  72.4  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000740491  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4207  biotin--protein ligase  29.7 
 
 
321 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000658318  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4512  biotin--protein ligase  29.7 
 
 
321 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000295045  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03807  hypothetical protein  29.7 
 
 
321 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0156142  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0132  biotin--protein ligase  27.59 
 
 
320 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000234608  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00240  biotin--protein ligase  25.17 
 
 
321 aa  70.5  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2876  biotin--protein ligase  23.79 
 
 
319 aa  70.9  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0268  biotin--protein ligase  28.95 
 
 
320 aa  70.5  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0393829  hitchhiker  0.0050705 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4072  biotin--protein ligase  28.25 
 
 
319 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.228403 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1781  birA bifunctional protein  28.28 
 
 
331 aa  69.7  0.00000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0174  biotin--protein ligase  27.6 
 
 
293 aa  69.7  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3895  biotin--protein ligase  28.42 
 
 
319 aa  69.3  0.00000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.282712  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3943  biotin--protein ligase  29.13 
 
 
320 aa  69.3  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.596693  decreased coverage  0.000472258 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0197  biotin--protein ligase  28 
 
 
317 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00143406  hitchhiker  0.000849017 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3253  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  29.15 
 
 
256 aa  69.3  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.147547 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0188  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  28.03 
 
 
269 aa  69.3  0.00000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3775  biotin--protein ligase  25.91 
 
 
319 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00231404  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0882  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  26.6 
 
 
276 aa  68.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.614952 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0875  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  29.03 
 
 
325 aa  68.6  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.107744  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0195  biotin--protein ligase  27.74 
 
 
319 aa  68.2  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000104624  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0154  biotin--protein ligase  27.72 
 
 
323 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00266236  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0073  biotin--protein ligase  27.62 
 
 
285 aa  67.4  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.702906 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4629  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  32.06 
 
 
283 aa  67  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4706  biotin--protein ligase  26.64 
 
 
320 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.144079  hitchhiker  0.00201782 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4404  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  26.94 
 
 
264 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.425757 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3184  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  22.06 
 
 
326 aa  66.2  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2919  biotin--protein ligase  26.3 
 
 
306 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6247  biotin--protein ligase  26.3 
 
 
306 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.791629 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2290  biotin--protein ligase  26.3 
 
 
306 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2904  biotin--protein ligase  26.3 
 
 
306 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.125895  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1295  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  26.72 
 
 
266 aa  64.7  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1044  biotin operon repressor  26.39 
 
 
323 aa  64.3  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0214  biotin--protein ligase  27.31 
 
 
319 aa  63.9  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0167  biotin--protein ligase  27.04 
 
 
293 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.862924 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0937  bifunctional protein birA  26.39 
 
 
323 aa  64.3  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1192  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  28.33 
 
 
251 aa  63.9  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.347029 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3284  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  25.98 
 
 
268 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.937339  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0935  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  24.09 
 
 
242 aa  63.9  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0183  biotin--protein ligase  26.82 
 
 
319 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00618712  normal  0.258521 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5200  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  26.82 
 
 
275 aa  63.9  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.105506  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0419  biotin--protein ligase  25.57 
 
 
310 aa  63.9  0.000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0182  biotin--protein ligase  26.82 
 
 
319 aa  63.9  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000279859  normal  0.096767 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0219  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  26.37 
 
 
322 aa  63.9  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.440436  normal  0.968546 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0437  biotin--protein ligase  25.99 
 
 
319 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.193351  hitchhiker  0.00820304 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2816  biotin--protein ligase  27.33 
 
 
306 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.688853  normal  0.200473 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2140  bifunctional BirA, biotin operon repressor/biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  24.67 
 
 
324 aa  63.2  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0470  biotin--protein ligase  25.99 
 
 
319 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0969933  normal  0.0169671 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4334  biotin--protein ligase  27.06 
 
 
320 aa  62.4  0.000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.152634  hitchhiker  0.00000000217796 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1873  biotin--protein ligase  31.11 
 
 
270 aa  62  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.149167 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0505  biotin-[acetyl-CoA-carboxylase] ligase  30.1 
 
 
282 aa  62  0.00000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002163  biotin-protein ligase/biotin operon repressor  30.98 
 
 
321 aa  62.4  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000294838  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0244  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  21.75 
 
 
329 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.63219  normal  0.860661 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1789  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  23.44 
 
 
326 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2553  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  29.49 
 
 
299 aa  61.6  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1015  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  20.98 
 
 
326 aa  61.2  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.207907  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0915  biotin--(acetyl-CoA-carboxylase) ligase  34.18 
 
 
332 aa  61.6  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.277179  decreased coverage  0.000000181101 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1326  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  28.93 
 
 
274 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.194167 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25430  birA, biotin-(acetyl-CoA-carboxylase) ligase  26.03 
 
 
282 aa  61.6  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.180915  normal  0.633613 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0984  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  25.12 
 
 
335 aa  61.2  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.381797 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0816  biotin--protein ligase  33.75 
 
 
293 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2418  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.87 
 
 
267 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.163893  hitchhiker  0.00859144 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4226  biotin--protein ligase  28.57 
 
 
305 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08620  biotin--protein ligase  31.01 
 
 
312 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000664696 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1071  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.79 
 
 
279 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.296292  normal  0.636766 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4766  biotin--protein ligase  32.9 
 
 
321 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0199355  normal  0.789599 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0467  biotin--protein ligase  32.26 
 
 
319 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.800228  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0102  biotin--protein ligase  34.87 
 
 
305 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04951  putative biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  26.32 
 
 
249 aa  60.5  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0453  birA bifunctional protein  26.92 
 
 
301 aa  60.1  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0263  biotin acetyl-CoA-carboxylase synthetase  27.53 
 
 
291 aa  60.1  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.147869 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>