237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0465 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0465  biotin/lipoate A/B protein ligase  100 
 
 
354 aa  722    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0315  biotin-(acetyl CoA carboxylase) holoenzyme synthetase  38.68 
 
 
324 aa  211  1e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0346  biotin/lipoate A/B protein ligase  38.8 
 
 
320 aa  211  1e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4716  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  32.95 
 
 
292 aa  80.9  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.492677  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3965  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.23 
 
 
308 aa  76.3  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.89958  normal  0.0374002 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08620  biotin--protein ligase  37.01 
 
 
312 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000664696 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0227  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  27.04 
 
 
262 aa  71.6  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00038256 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4072  biotin--protein ligase  31.49 
 
 
319 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.228403 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0816  biotin--protein ligase  35.71 
 
 
293 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0142  biotin--protein ligase  33.94 
 
 
319 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.330287  normal  0.0344662 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0154  biotin--protein ligase  27.08 
 
 
323 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00266236  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3775  biotin--protein ligase  26.18 
 
 
319 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00231404  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4174  biotin--protein ligase  32.16 
 
 
319 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000228488  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1044  biotin operon repressor  38.35 
 
 
323 aa  70.1  0.00000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0180  biotin--protein ligase  32.16 
 
 
319 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0210584  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0184  biotin--protein ligase  32.16 
 
 
319 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.570128  hitchhiker  0.00065537 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0937  bifunctional protein birA  38.35 
 
 
323 aa  70.1  0.00000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4404  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.52 
 
 
264 aa  69.3  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.425757 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1781  birA bifunctional protein  34.46 
 
 
331 aa  69.3  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0197  biotin--protein ligase  32.02 
 
 
317 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00143406  hitchhiker  0.000849017 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4766  biotin--protein ligase  33.12 
 
 
321 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0199355  normal  0.789599 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4706  biotin--protein ligase  33.13 
 
 
320 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.144079  hitchhiker  0.00201782 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0214  biotin--protein ligase  30.99 
 
 
319 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00240  biotin--protein ligase  24.68 
 
 
321 aa  67.4  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0470  biotin--protein ligase  33.77 
 
 
319 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0969933  normal  0.0169671 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04571  putative biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  29.9 
 
 
249 aa  66.6  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0437  biotin--protein ligase  33.77 
 
 
319 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.193351  hitchhiker  0.00820304 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4629  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  32.2 
 
 
283 aa  66.2  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0183  biotin--protein ligase  29.82 
 
 
319 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00618712  normal  0.258521 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0182  biotin--protein ligase  29.82 
 
 
319 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000279859  normal  0.096767 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0610  birA bifunctional protein  34.42 
 
 
319 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3926  biotin--protein ligase  33.76 
 
 
321 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541608  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0432  putative biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  25.75 
 
 
249 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0168  biotin--protein ligase  30.77 
 
 
320 aa  64.7  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00063361  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2717  biotin--protein ligase  26.55 
 
 
320 aa  64.3  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000120108  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3757  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  36.54 
 
 
267 aa  64.3  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.450721 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4546  biotin--protein ligase  32.2 
 
 
320 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000449604  hitchhiker  0.00000000138084 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4468  biotin--protein ligase  32.2 
 
 
320 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0221784  hitchhiker  0.00169649 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4349  biotin--protein ligase  32.2 
 
 
320 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000983671  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4471  biotin--protein ligase  32.2 
 
 
320 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000340796  hitchhiker  0.00000000000240151 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3871  biotin--protein ligase  35.54 
 
 
319 aa  64.3  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000364778  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3396  biotin--protein ligase  35.54 
 
 
319 aa  64.3  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.199101  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0327  biotin--protein ligase  35.54 
 
 
319 aa  64.3  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0364706  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4381  biotin--protein ligase  32.2 
 
 
320 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4564  biotin--protein ligase  33.12 
 
 
335 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1873  biotin--protein ligase  32.96 
 
 
270 aa  63.9  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.149167 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4226  biotin--protein ligase  25.75 
 
 
305 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2206  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.84 
 
 
270 aa  63.9  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04881  putative biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  28.87 
 
 
249 aa  63.9  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.237846  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0467  biotin--protein ligase  33.54 
 
 
319 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.800228  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0882  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.89 
 
 
276 aa  63.5  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.614952 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0132  biotin--protein ligase  24.52 
 
 
320 aa  63.5  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000234608  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002163  biotin-protein ligase/biotin operon repressor  29.94 
 
 
321 aa  63.5  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000294838  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0915  biotin--(acetyl-CoA-carboxylase) ligase  30 
 
 
332 aa  63.2  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.277179  decreased coverage  0.000000181101 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0263  biotin acetyl-CoA-carboxylase synthetase  25.56 
 
 
291 aa  63.5  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.147869 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4745  biotin--protein ligase  35.12 
 
 
333 aa  62  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.167382  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2876  biotin--protein ligase  31.01 
 
 
319 aa  62.4  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0490  biotin--protein ligase  25.32 
 
 
297 aa  62  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0887139 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04951  putative biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  27.93 
 
 
249 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1773  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.33 
 
 
242 aa  62  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2081  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  37.82 
 
 
325 aa  61.6  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4140  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.17 
 
 
264 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0219  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  32.3 
 
 
322 aa  60.8  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.440436  normal  0.968546 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3943  biotin--protein ligase  32.12 
 
 
320 aa  61.2  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.596693  decreased coverage  0.000472258 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0204  biotin--protein ligase  27.41 
 
 
319 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05900  birA, biotin-(acetyl-CoA-carboxylase) ligase  33.97 
 
 
275 aa  60.8  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.402573 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0935  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.87 
 
 
242 aa  60.1  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2082  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  25.24 
 
 
329 aa  60.5  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06050  biotin--protein ligase  38.79 
 
 
330 aa  60.1  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06231  putative biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  28.72 
 
 
252 aa  60.1  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0412203 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03854  biotin-protein ligase  32.52 
 
 
321 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0188201  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03807  hypothetical protein  32.52 
 
 
321 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0156142  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4207  biotin--protein ligase  32.52 
 
 
321 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000658318  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4461  biotin--protein ligase  32.52 
 
 
321 aa  59.7  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000740491  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4047  biotin--protein ligase  32.52 
 
 
321 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0641292  hitchhiker  0.00297103 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3352  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  29.81 
 
 
288 aa  60.1  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.0000000222923  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4512  biotin--protein ligase  32.52 
 
 
321 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000295045  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4017  bifunctional BirA, biotin operon repressor/biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  32.52 
 
 
321 aa  59.3  0.00000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0118949  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4619  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.73 
 
 
255 aa  59.3  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0214611 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0268  biotin--protein ligase  28.65 
 
 
320 aa  59.3  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0393829  hitchhiker  0.0050705 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4421  biotin--protein ligase  32 
 
 
321 aa  59.3  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000434302  hitchhiker  0.00072275 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5438  biotin--protein ligase  32 
 
 
321 aa  59.3  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000183056  hitchhiker  0.00134266 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3740  biotin--protein ligase  33.99 
 
 
319 aa  58.9  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00032759  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1990  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  32.17 
 
 
251 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2418  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.85 
 
 
267 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.163893  hitchhiker  0.00859144 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0406  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  30 
 
 
326 aa  58.2  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.617579  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0847  biotin-[acetylCoA carboxylase] holoenzyme synthetase and biotin operon repressor  32.03 
 
 
331 aa  57.8  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3998  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.38 
 
 
328 aa  57.8  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00153965  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0419  biotin--protein ligase  31.15 
 
 
310 aa  57.8  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4334  biotin--protein ligase  31.4 
 
 
320 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.152634  hitchhiker  0.00000000217796 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0851  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.11 
 
 
278 aa  57  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000131196  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4292  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.66 
 
 
317 aa  57  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.422429  hitchhiker  0.0000115964 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1200  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  29.48 
 
 
279 aa  57  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03573  putative BirA bifunctional protein  28.93 
 
 
328 aa  56.6  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.184427  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0822  biotin-[acetylCoA carboxylase] holoenzyme synthetase and biotin operon repressor  32.03 
 
 
333 aa  56.6  0.0000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04301  putative biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  27.32 
 
 
252 aa  56.2  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2871  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  30 
 
 
269 aa  56.2  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.336309  normal  0.418687 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1071  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.64 
 
 
279 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.296292  normal  0.636766 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3992  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.39 
 
 
285 aa  56.2  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.182521 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1504  hypothetical protein  30.48 
 
 
270 aa  55.8  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>