More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4619 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4619  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  100 
 
 
255 aa  513  1e-144  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0214611 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4404  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  45 
 
 
264 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.425757 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2409  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  40.5 
 
 
265 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0816  biotin--protein ligase  40.91 
 
 
265 aa  172  5e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.870117  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0811  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  40.5 
 
 
265 aa  170  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1036  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  41.53 
 
 
274 aa  167  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.652597  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4140  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  42.5 
 
 
264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2871  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  40.16 
 
 
269 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.336309  normal  0.418687 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1071  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  42.58 
 
 
279 aa  158  6e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.296292  normal  0.636766 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2384  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  41.53 
 
 
264 aa  158  7e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1200  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  42.19 
 
 
279 aa  156  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1005  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  42.64 
 
 
281 aa  156  3e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0220561  normal  0.146847 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2932  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  43.93 
 
 
259 aa  156  4e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1730  birA bifunctional protein  39.41 
 
 
262 aa  153  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0817541  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2418  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  39.36 
 
 
267 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.163893  hitchhiker  0.00859144 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2045  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  43.09 
 
 
267 aa  150  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.293027  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1275  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  39.24 
 
 
254 aa  149  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192065  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4547  putative biotin--(acetyl-CoA-carboxylase) synthetase  39.2 
 
 
269 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.294789  normal  0.109394 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3212  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  41.25 
 
 
252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187733  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0792  biotin-[acetyl-CoA-carboxylase] ligase  33.47 
 
 
266 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0251004  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2206  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  38.55 
 
 
270 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1873  biotin--protein ligase  40.65 
 
 
270 aa  144  1e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.149167 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2588  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  38.21 
 
 
271 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.375496  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3284  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  39.75 
 
 
268 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.937339  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2532  putative biotin protein ligase  40.35 
 
 
242 aa  143  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0413921  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1192  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  40.35 
 
 
251 aa  142  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.347029 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0904  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  41.81 
 
 
255 aa  142  7e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1367  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  38.82 
 
 
254 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2818  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  41.06 
 
 
250 aa  137  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.499637 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1295  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  41.56 
 
 
266 aa  135  8e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2286  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  40.24 
 
 
243 aa  134  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1369  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  39.66 
 
 
249 aa  131  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0213578 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1197  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  39.11 
 
 
251 aa  129  6e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0761  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  39.46 
 
 
249 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08620  biotin--protein ligase  37.8 
 
 
312 aa  125  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000664696 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2230  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  39.33 
 
 
252 aa  125  8.000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3341  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  39.74 
 
 
260 aa  124  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1990  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  38.46 
 
 
251 aa  122  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0816  biotin--protein ligase  37.86 
 
 
293 aa  119  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1330  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  37.72 
 
 
251 aa  120  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.523824  normal  0.0143061 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2999  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  38.8 
 
 
261 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4766  biotin--protein ligase  34.57 
 
 
321 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0199355  normal  0.789599 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0937  bifunctional protein birA  31.6 
 
 
323 aa  112  4.0000000000000004e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1044  biotin operon repressor  31.6 
 
 
323 aa  112  4.0000000000000004e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0490  biotin--protein ligase  35.96 
 
 
297 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0887139 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1971  biotin-(acetyl-CoA carboxylase) holoenzyme synthetase and biotin operon repressor  33.72 
 
 
327 aa  107  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1261  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.04 
 
 
326 aa  107  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1569  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  38.07 
 
 
259 aa  107  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.747417  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0467  biotin--protein ligase  32.1 
 
 
319 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.800228  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3926  biotin--protein ligase  32.93 
 
 
321 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541608  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3752  biotin operon repressor/biotin-[acetyl-CoA-carboxylase] ligase  30.28 
 
 
326 aa  107  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4226  biotin--protein ligase  35.71 
 
 
305 aa  106  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0470  biotin--protein ligase  32.27 
 
 
319 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0969933  normal  0.0169671 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0437  biotin--protein ligase  32.39 
 
 
319 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.193351  hitchhiker  0.00820304 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1593  biotin operon repressor/biotin-[acetyl-CoA-carboxylase] ligase  30.28 
 
 
326 aa  106  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.624348  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1317  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  35.86 
 
 
328 aa  106  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.61009  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6389  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.58 
 
 
253 aa  105  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00441767  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1704  biotin operon repressor/biotin-[acetyl-CoA-carboxylase] ligase  30.28 
 
 
326 aa  105  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0104372  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1631  biotin operon repressor/biotin-[acetyl-CoA-carboxylase] ligase  30.28 
 
 
326 aa  105  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.104533 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1447  birA bifunctional protein  30.28 
 
 
326 aa  105  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.867427  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1560  bifunctional biotin operon repressor/biotin--[acetyl-CoA-carboxylase] synthetase  30.28 
 
 
326 aa  105  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1987  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.86 
 
 
338 aa  105  7e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.417612  normal  0.841631 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0935  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.85 
 
 
242 aa  105  9e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1419  biotin operon repressor  30.28 
 
 
326 aa  105  9e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2817  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.68 
 
 
336 aa  105  9e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000210207  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1666  birA bifunctional protein  29.82 
 
 
326 aa  104  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0204  biotin--protein ligase  36.7 
 
 
319 aa  104  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1479  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  36.99 
 
 
329 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0876973  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0654  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  36.25 
 
 
324 aa  105  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2459  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.88 
 
 
329 aa  103  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.472126  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002163  biotin-protein ligase/biotin operon repressor  34.41 
 
 
321 aa  104  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000294838  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1463  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.28 
 
 
326 aa  102  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5096  biotin--protein ligase  36.25 
 
 
317 aa  102  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000301513  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2320  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  35.74 
 
 
327 aa  102  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0571544  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1903  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.35 
 
 
327 aa  102  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.37759 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1056  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  34 
 
 
287 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1420  biotin operon repressor  29.82 
 
 
326 aa  102  8e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1935  birA biofunctional protein, putative  34.65 
 
 
323 aa  101  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.976784  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0970  biotin protein ligase, putative  35.43 
 
 
347 aa  100  2e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.668345  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0086  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  30 
 
 
332 aa  100  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.296315  normal  0.688317 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2119  bifunctional BirA, biotin operon repressor/biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.03 
 
 
329 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1058  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.05 
 
 
326 aa  100  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.101759  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0085  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.74 
 
 
323 aa  100  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00153974  normal  0.0550519 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0077  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.61 
 
 
327 aa  99.4  5e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1476  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  35.63 
 
 
330 aa  98.6  8e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.699124  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4564  biotin--protein ligase  33.2 
 
 
335 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3227  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  35.41 
 
 
267 aa  97.8  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.198743 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0244  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  29.54 
 
 
329 aa  98.6  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.63219  normal  0.860661 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0610  birA bifunctional protein  32.92 
 
 
319 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1571  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  36.65 
 
 
330 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.929422  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1588  biotin--(acetyl-COA-carboxylase) synthetase  29.51 
 
 
326 aa  96.7  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.202289  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13308  bifunctional protein birA: biotin operon repressor + biotin-[acetyl-CoA-carboxylase] synthetase  37.45 
 
 
266 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0240  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  25.46 
 
 
247 aa  95.9  5e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3757  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.84 
 
 
267 aa  95.5  7e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.450721 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0701  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  37.09 
 
 
310 aa  95.5  7e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.476983 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4174  biotin--protein ligase  29.63 
 
 
319 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000228488  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2717  biotin--protein ligase  33.07 
 
 
320 aa  94.7  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000120108  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0184  biotin--protein ligase  29.63 
 
 
319 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.570128  hitchhiker  0.00065537 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0848  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  27.52 
 
 
251 aa  94.7  1e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.238001  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0132  biotin--protein ligase  28.81 
 
 
320 aa  94.7  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000234608  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>