More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1990 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1990  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  100 
 
 
251 aa  500  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1192  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  84.86 
 
 
251 aa  420  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.347029 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2532  putative biotin protein ligase  83.88 
 
 
242 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0413921  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1330  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  62.7 
 
 
251 aa  294  9e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.523824  normal  0.0143061 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0761  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  61.38 
 
 
249 aa  285  4e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2230  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  61.45 
 
 
252 aa  279  3e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1197  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  56.68 
 
 
251 aa  245  6e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2871  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  38.96 
 
 
269 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.336309  normal  0.418687 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4140  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  41.02 
 
 
264 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1369  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  40.17 
 
 
249 aa  133  3e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0213578 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0792  biotin-[acetyl-CoA-carboxylase] ligase  33.33 
 
 
266 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0251004  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1071  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  39.93 
 
 
279 aa  132  6e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.296292  normal  0.636766 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2409  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  36.84 
 
 
265 aa  130  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0816  biotin--protein ligase  36.9 
 
 
265 aa  129  4.0000000000000003e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.870117  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2818  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  41.87 
 
 
250 aa  129  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.499637 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3212  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  43.33 
 
 
252 aa  129  5.0000000000000004e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187733  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2206  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  37.6 
 
 
270 aa  129  6e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4404  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  41.51 
 
 
264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.425757 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0811  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  36.51 
 
 
265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3284  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  38.55 
 
 
268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.937339  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4547  putative biotin--(acetyl-CoA-carboxylase) synthetase  38.53 
 
 
269 aa  126  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.294789  normal  0.109394 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1036  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  37.31 
 
 
274 aa  126  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.652597  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1873  biotin--protein ligase  37.35 
 
 
270 aa  124  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.149167 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2418  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  38.96 
 
 
267 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.163893  hitchhiker  0.00859144 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4619  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  38.46 
 
 
255 aa  122  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0214611 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1200  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  38.78 
 
 
279 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1005  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  37.78 
 
 
281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0220561  normal  0.146847 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2932  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  39.08 
 
 
259 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1935  birA biofunctional protein, putative  35.81 
 
 
323 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.976784  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1569  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  42.27 
 
 
259 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.747417  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2588  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.77 
 
 
271 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.375496  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2320  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  35.06 
 
 
327 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0571544  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1987  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  36.12 
 
 
338 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.417612  normal  0.841631 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1903  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.33 
 
 
327 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.37759 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0848  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  28.12 
 
 
251 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.238001  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1317  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  35.93 
 
 
328 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.61009  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2384  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  35.98 
 
 
264 aa  112  8.000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0240  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  27.42 
 
 
247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0142  biotin--protein ligase  33.91 
 
 
319 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.330287  normal  0.0344662 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4745  biotin--protein ligase  33.62 
 
 
333 aa  109  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.167382  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2817  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  32.6 
 
 
336 aa  107  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000210207  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0775  transcriptional repressor of the biotin operon / biotin acetyl-CoA-carboxylase synthetase; RBL03563  31.98 
 
 
325 aa  107  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000728901  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0500  bifunctional BirA, biotin operon repressor/biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  32.65 
 
 
329 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3341  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  35.59 
 
 
260 aa  106  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4072  biotin--protein ligase  32.07 
 
 
319 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.228403 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4174  biotin--protein ligase  32.77 
 
 
319 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000228488  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0180  biotin--protein ligase  32.77 
 
 
319 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0210584  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2045  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  39.92 
 
 
267 aa  105  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.293027  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0184  biotin--protein ligase  32.35 
 
 
319 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.570128  hitchhiker  0.00065537 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08620  biotin--protein ligase  39.82 
 
 
312 aa  105  7e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000664696 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0244  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  32.5 
 
 
329 aa  105  8e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.63219  normal  0.860661 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4564  biotin--protein ligase  35.71 
 
 
335 aa  105  9e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0168  biotin--protein ligase  32.08 
 
 
320 aa  104  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00063361  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3775  biotin--protein ligase  33.47 
 
 
319 aa  104  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00231404  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0182  biotin--protein ligase  32.35 
 
 
319 aa  103  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000279859  normal  0.096767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0183  biotin--protein ligase  32.35 
 
 
319 aa  103  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00618712  normal  0.258521 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4766  biotin--protein ligase  34.3 
 
 
321 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0199355  normal  0.789599 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0935  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  35.18 
 
 
242 aa  102  6e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0654  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  32.2 
 
 
324 aa  101  9e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0437  biotin--protein ligase  33.75 
 
 
319 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.193351  hitchhiker  0.00820304 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0470  biotin--protein ligase  33.75 
 
 
319 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0969933  normal  0.0169671 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0812  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  32.11 
 
 
336 aa  101  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2999  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.71 
 
 
261 aa  100  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1295  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  36.94 
 
 
266 aa  100  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0768  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  28.99 
 
 
262 aa  100  3e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0970  biotin protein ligase, putative  33.91 
 
 
347 aa  99.8  4e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.668345  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0467  biotin--protein ligase  33.75 
 
 
319 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.800228  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2427  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  28.27 
 
 
321 aa  99.4  5e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3351  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.6 
 
 
272 aa  99.4  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.417142  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1588  biotin--(acetyl-COA-carboxylase) synthetase  29.96 
 
 
326 aa  99  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.202289  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0391  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.75 
 
 
240 aa  99  6e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1704  biotin operon repressor/biotin-[acetyl-CoA-carboxylase] ligase  29.26 
 
 
326 aa  99  7e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0104372  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1058  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.04 
 
 
326 aa  98.6  8e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.101759  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06050  biotin--protein ligase  34.6 
 
 
330 aa  97.4  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1420  biotin operon repressor  28.82 
 
 
326 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3752  biotin operon repressor/biotin-[acetyl-CoA-carboxylase] ligase  30.17 
 
 
326 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2119  bifunctional BirA, biotin operon repressor/biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  29.06 
 
 
329 aa  97.4  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1593  biotin operon repressor/biotin-[acetyl-CoA-carboxylase] ligase  29.74 
 
 
326 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.624348  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1463  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  29.26 
 
 
326 aa  97.1  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3926  biotin--protein ligase  33.93 
 
 
321 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541608  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1447  birA bifunctional protein  28.82 
 
 
326 aa  96.7  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.867427  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1560  bifunctional biotin operon repressor/biotin--[acetyl-CoA-carboxylase] synthetase  28.82 
 
 
326 aa  96.7  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0816  biotin--protein ligase  36.75 
 
 
293 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1631  biotin operon repressor/biotin-[acetyl-CoA-carboxylase] ligase  28.82 
 
 
326 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.104533 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1666  birA bifunctional protein  28.82 
 
 
326 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0214  biotin--protein ligase  30.67 
 
 
319 aa  96.3  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1419  biotin operon repressor  28.82 
 
 
326 aa  96.3  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_753  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase/ BirA family transcriptional regulator  29.86 
 
 
262 aa  95.9  6e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0984  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  29.05 
 
 
335 aa  95.5  7e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.381797 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0610  birA bifunctional protein  35.09 
 
 
319 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0197  biotin--protein ligase  32.77 
 
 
317 aa  95.1  8e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00143406  hitchhiker  0.000849017 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1261  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  29.91 
 
 
326 aa  94.4  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3740  biotin--protein ligase  33.05 
 
 
319 aa  95.1  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00032759  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6032  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  36.55 
 
 
244 aa  94.4  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0154  biotin--protein ligase  30.51 
 
 
323 aa  94  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00266236  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0268  biotin--protein ligase  33.33 
 
 
320 aa  93.6  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0393829  hitchhiker  0.0050705 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1971  biotin-(acetyl-CoA carboxylase) holoenzyme synthetase and biotin operon repressor  33.33 
 
 
327 aa  93.6  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00240  biotin--protein ligase  30.54 
 
 
321 aa  93.2  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1653  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.61 
 
 
333 aa  92.8  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2717  biotin--protein ligase  30.77 
 
 
320 aa  92.8  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000120108  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>