More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1754 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3219  peptide chain release factor 3  67.26 
 
 		 538 aa  718    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.76683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6925  peptide chain release factor 3  63.27 
 
 		 533 aa  673    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.209121  normal  0.303865 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1754  peptide chain release factor 3  100 
 
 		 506 aa  1043    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.275542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2330  peptide chain release factor 3  67.26 
 
 		 535 aa  728    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3808  peptide chain release factor 3  66.87 
 
 		 538 aa  716    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2968  peptide chain release factor 3  63.27 
 
 		 533 aa  673    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.720802 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4287  peptide chain release factor 3  63.38 
 
 		 533 aa  672    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3858  peptide chain release factor 3  67.4 
 
 		 547 aa  727    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2036  peptide chain release factor 3  96.05 
 
 		 507 aa  1006    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0645  peptide chain release factor 3  59.3 
 
 		 543 aa  632  1e-180  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.563471  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4062  peptide chain release factor 3  58.12 
 
 		 542 aa  625  1e-178  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4686  peptide chain release factor 3  57.45 
 
 		 542 aa  621  1e-177  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0657  peptide chain release factor 3  57.51 
 
 		 540 aa  612  9.999999999999999e-175  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0802538 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0596  peptide chain release factor 3  56.08 
 
 		 541 aa  610  1e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0617  peptide chain release factor 3  56.08 
 
 		 541 aa  609  1e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5926  peptide chain release factor 3  55.8 
 
 		 565 aa  605  9.999999999999999e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2514  peptide chain release factor 3  56.34 
 
 		 539 aa  591  1e-167  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2144  peptide chain release factor 3  56.34 
 
 		 539 aa  591  1e-167  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.280372  hitchhiker  0.00257154 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0968  peptide chain release factor 3  55.31 
 
 		 543 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.977047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3282  peptide chain release factor 3  58.32 
 
 		 547 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.600157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2019  peptide chain release factor 3  55.04 
 
 		 542 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0147  peptide chain release factor 3  54.51 
 
 		 535 aa  568  1e-161  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1821  peptide chain release factor 3  53.83 
 
 		 536 aa  566  1e-160  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0192  peptide chain release factor 3  55.44 
 
 		 527 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000119387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2730  peptide chain release factor 3  53.43 
 
 		 524 aa  558  1e-158  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.426753  normal  0.414685 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3872  peptide chain release factor 3  54.29 
 
 		 531 aa  555  1e-157  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3761  peptide chain release factor 3  54.29 
 
 		 531 aa  555  1e-157  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.106529 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0138  peptide chain release factor 3  54.64 
 
 		 526 aa  554  1e-156  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1990  peptide chain release factor 3  53.74 
 
 		 526 aa  553  1e-156  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.919735  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1662  peptide chain release factor 3  53.31 
 
 		 533 aa  553  1e-156  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.828617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0414  peptide chain release factor 3  53.44 
 
 		 531 aa  553  1e-156  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1393  peptide chain release factor 3  53.13 
 
 		 524 aa  552  1e-156  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.263078  normal  0.346403 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1490  peptide chain release factor 3  54.22 
 
 		 535 aa  553  1e-156  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000251643  hitchhiker  0.00000000120572 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1737  peptide chain release factor 3  53.64 
 
 		 524 aa  551  1e-155  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000804887 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0147  peptide chain release factor 3  52.92 
 
 		 534 aa  548  1e-155  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01678  peptide chain release factor 3  52.62 
 
 		 534 aa  548  1e-155  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.790822  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2642  peptide chain release factor 3  55.01 
 
 		 528 aa  550  1e-155  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.495995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0877  peptide chain release factor 3  52.22 
 
 		 525 aa  545  1e-154  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0583  peptide chain release factor 3  53.13 
 
 		 528 aa  546  1e-154  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.704110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0130  peptide chain release factor 3  52.92 
 
 		 534 aa  547  1e-154  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.174893  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5808  peptide chain release factor 3  54.09 
 
 		 530 aa  548  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1774  peptide chain release factor 3  52.22 
 
 		 530 aa  546  1e-154  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.119545  normal  0.691586 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2146  peptide chain release factor 3  52.22 
 
 		 531 aa  546  1e-154  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0435  peptide chain release factor 3  53.04 
 
 		 531 aa  547  1e-154  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1140  peptide chain release factor 3  52.22 
 
 		 525 aa  545  1e-154  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0935  peptide chain release factor 3  52.12 
 
 		 526 aa  542  1e-153  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0905  peptide chain release factor 3  51.72 
 
 		 526 aa  540  9.999999999999999e-153  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5334  peptide chain release factor 3  52.58 
 
 		 533 aa  539  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490929  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0970  peptide chain release factor 3  51.52 
 
 		 524 aa  538  9.999999999999999e-153  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00550606  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3935  peptide chain release factor 3  53.63 
 
 		 526 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.582283  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3053  peptide chain release factor 3  52.11 
 
 		 534 aa  539  9.999999999999999e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0754229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0882  peptide chain release factor 3  53.02 
 
 		 527 aa  541  9.999999999999999e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4412  peptide chain release factor 3  54.03 
 
 		 527 aa  536  1e-151  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000888652  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4019  peptide chain release factor 3  53.43 
 
 		 526 aa  538  1e-151  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.5160199999999995e-20 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2372  peptide chain release factor 3  53.33 
 
 		 529 aa  534  1e-150  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0266  peptide chain release factor 3  52.32 
 
 		 529 aa  533  1e-150  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.580519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2046  peptide chain release factor 3  50.4 
 
 		 531 aa  530  1e-149  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.840556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2092  peptide chain release factor 3  50.6 
 
 		 528 aa  529  1e-149  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.429177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2819  peptide chain release factor 3  52.42 
 
 		 528 aa  526  1e-148  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4253  peptide chain release factor 3  50.3 
 
 		 527 aa  526  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.995333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4609  peptide chain release factor 3  49.8 
 
 		 529 aa  525  1e-148  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00121865  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1828  peptide chain release factor 3  50.1 
 
 		 544 aa  526  1e-148  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4918  peptide chain release factor 3  49.8 
 
 		 529 aa  525  1e-148  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.100391  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4971  peptide chain release factor 3  49.8 
 
 		 529 aa  525  1e-148  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00185733  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3682  peptide chain release factor 3  49.8 
 
 		 529 aa  525  1e-148  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.297475  hitchhiker  0.00075439 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2474  peptide chain release factor 3  50.3 
 
 		 526 aa  525  1e-148  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04250  peptide chain release factor 3  49.8 
 
 		 529 aa  525  1e-147  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.631503  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3624  peptide chain release factor 3  49.8 
 
 		 529 aa  525  1e-147  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0792  peptide chain release factor 3  50.51 
 
 		 527 aa  522  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.735214  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4579  peptide chain release factor 3  49.9 
 
 		 527 aa  522  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0807  peptide chain release factor 3  49.9 
 
 		 527 aa  524  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.986611  normal  0.435335 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04216  hypothetical protein  49.8 
 
 		 529 aa  525  1e-147  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.659942  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1011  peptide chain release factor 3  49.49 
 
 		 528 aa  524  1e-147  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2519  peptide chain release factor 3  50.51 
 
 		 527 aa  524  1e-147  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0422  peptide chain release factor 3  49.4 
 
 		 531 aa  523  1e-147  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5887  peptide chain release factor 3  49.8 
 
 		 529 aa  525  1e-147  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.397514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4922  peptide chain release factor 3  49.8 
 
 		 529 aa  525  1e-147  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.55632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13410  peptide chain release factor 3  50.1 
 
 		 527 aa  524  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.898041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0551  peptide chain release factor 3  50 
 
 		 529 aa  523  1e-147  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0015  peptide chain release factor 3  51.42 
 
 		 517 aa  519  1e-146  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0380  peptide chain release factor 3  49.19 
 
 		 531 aa  521  1e-146  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.864644 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0453  peptide chain release factor 3  49.4 
 
 		 529 aa  518  1e-146  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.267512  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1202  peptide chain release factor 3  49.7 
 
 		 527 aa  521  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3649  peptide chain release factor 3  52.02 
 
 		 528 aa  521  1e-146  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2497  peptide chain release factor 3  51.41 
 
 		 530 aa  520  1e-146  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4306  peptide chain release factor 3  49.7 
 
 		 527 aa  521  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.546945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4916  peptide chain release factor 3  49.4 
 
 		 529 aa  518  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.996004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4881  peptide chain release factor 3  49.4 
 
 		 529 aa  518  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.180345  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4813  peptide chain release factor 3  49.4 
 
 		 529 aa  518  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4968  peptide chain release factor 3  49.4 
 
 		 529 aa  518  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4974  peptide chain release factor 3  49.4 
 
 		 529 aa  518  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.219451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2820  peptide chain release factor 3  49.7 
 
 		 526 aa  521  1e-146  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0200081  hitchhiker  0.0000558993 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0872  peptide chain release factor 3  49.49 
 
 		 527 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126869  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1111  peptide chain release factor 3  49.09 
 
 		 526 aa  518  1.0000000000000001e-145  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3554  peptide chain release factor 3  49.29 
 
 		 526 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.93604  decreased coverage  0.000001078 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0384  peptide chain release factor 3  49.8 
 
 		 526 aa  515  1.0000000000000001e-145  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0534  peptide chain release factor 3  50 
 
 		 529 aa  517  1.0000000000000001e-145  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.319663  hitchhiker  0.0098421 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1678  peptide chain release factor 3  51.31 
 
 		 533 aa  515  1.0000000000000001e-145  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0068133  normal  0.55837 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3466  peptide chain release factor 3  49.8 
 
 		 529 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4261  peptide chain release factor 3  49.6 
 
 		 539 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.3422  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>