More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3173 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3173  transposase, IS605 OrfB  100 
 
 		 474 aa  979    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.184045 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1611  IS605 family transposase OrfB  28.64 
 
 		 402 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1058  ISAfe8, transposase  29.44 
 
 		 408 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.19621  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1215  ISAfe8, transposase  29.44 
 
 		 408 aa  147  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.630529  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3630  transposase, IS605 orfB family  29.47 
 
 		 402 aa  147  5e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000427387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1062  IS605 family transposase orfB  28.41 
 
 		 402 aa  146  6e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000017458  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01390  predicted transposase  29.47 
 
 		 402 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01400  hypothetical protein  29.47 
 
 		 402 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5722  transposase, IS605 orfB family  29.3 
 
 		 402 aa  145  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000324341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1516  IS605 family transposase OrfB  29.23 
 
 		 402 aa  144  4e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0023  IS605 family transposase OrfB  30.09 
 
 		 402 aa  143  6e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2022  IS605 family transposase OrfB  29 
 
 		 402 aa  143  7e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000253507  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7257  IS605 family transposase OrfB  31.71 
 
 		 399 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.793072  normal  0.105213 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2166  IS605 family transposase OrfB  29.14 
 
 		 387 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3890  IS605 family transposase OrfB  28.6 
 
 		 402 aa  141  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5398  transposase  31.16 
 
 		 422 aa  140  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2214  transposase, IS605 OrfB family  29.02 
 
 		 382 aa  139  7e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.645387  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2227  IS605 family transposase OrfB  29.02 
 
 		 382 aa  139  7e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.722641 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5918  IS605 family transposase OrfB  31.58 
 
 		 399 aa  138  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.320804 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4187  IS605 family transposase OrfB  31.31 
 
 		 422 aa  138  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0613  IS605 family transposase OrfB  27.8 
 
 		 411 aa  138  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0448  IS605 family transposase orfB  28.37 
 
 		 402 aa  139  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1294  IS605 family transposase OrfB  26.96 
 
 		 411 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3066  IS605 family transposase OrfB  28.27 
 
 		 402 aa  136  9e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3236  IS200 transposase orfB  30.24 
 
 		 399 aa  134  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.48969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3797  IS605 family transposase OrfB  30.33 
 
 		 429 aa  134  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.414505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6349  transposase  30.79 
 
 		 429 aa  131  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0279  IS605 family transposase OrfB  26.54 
 
 		 411 aa  131  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2764  IS605 family transposase OrfB  27.91 
 
 		 411 aa  126  8.000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432246  normal  0.196965 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1133  transposase, IS605 OrfB  31.07 
 
 		 397 aa  125  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1324  transposase  31.07 
 
 		 397 aa  125  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0532148  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5850  IS605 family transposase OrfB  29.52 
 
 		 399 aa  126  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2963  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  37.1 
 
 		 399 aa  125  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.268101  normal  0.616422 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3266  transposase  37.1 
 
 		 399 aa  125  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.364761 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1278  IS605 family transposase OrfB  26.88 
 
 		 413 aa  124  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.716474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00750  Transposase, IS891/IS1136/IS1341/IS605  27.42 
 
 		 403 aa  124  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0714  IS605 family transposase OrfB  33.82 
 
 		 381 aa  123  7e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0845  IS605 family transposase OrfB  33.82 
 
 		 381 aa  123  8e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3502  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  29.29 
 
 		 406 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6989  transposase  27.21 
 
 		 400 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0649  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  31.8 
 
 		 435 aa  122  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1215  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  29.52 
 
 		 399 aa  122  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0567342  normal  0.0860408 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3880  IS605 family transposase OrfB  26.23 
 
 		 411 aa  120  7e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3183  transposase, IS605 OrfB family  28.41 
 
 		 496 aa  120  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3319  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  29.7 
 
 		 415 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.947288 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15780  transposase, IS891/IS1136/IS1341  25.66 
 
 		 406 aa  118  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42370  transposase  26.07 
 
 		 403 aa  117  5e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16800  transposase, IS605  25.6 
 
 		 403 aa  116  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1584  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  28.87 
 
 		 417 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200242  normal  0.758267 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0778  transposase, IS605 OrfB family  27.35 
 
 		 500 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2243  transposase, IS605 OrfB family  29.26 
 
 		 424 aa  111  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5691  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  29.38 
 
 		 396 aa  107  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5477  IS605 family transposase OrfB  28.27 
 
 		 416 aa  106  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.461601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4127  transposase IS605 OrfB  39.66 
 
 		 494 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0486  transposase  26.49 
 
 		 348 aa  105  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0583  transposase  26.49 
 
 		 348 aa  105  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4167  transposase IS605 OrfB  39.08 
 
 		 494 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.220651  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1819  transposase, IS605 OrfB family  30.29 
 
 		 410 aa  105  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.538618 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2560  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  27.31 
 
 		 431 aa  104  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.747478  normal  0.0116534 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05900  transposase IS891/IS1136/IS1341  28.64 
 
 		 381 aa  104  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.542736  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1677  putative transposase IS605 family  25.98 
 
 		 449 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2689  transposase, IS605 OrfB family  24 
 
 		 363 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2738  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  27.27 
 
 		 361 aa  101  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1464  transposase, IS605 OrfB family  24.94 
 
 		 363 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3814  transposase, IS605 OrfB family  24.24 
 
 		 363 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000135622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1017  transposase IS605 OrfB family  28.77 
 
 		 406 aa  102  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.347453  hitchhiker  0.000143802 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1346  transposase, IS605 OrfB family  27.63 
 
 		 391 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2754  transposase, IS605 OrfB family  24.65 
 
 		 363 aa  100  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1800  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  32.5 
 
 		 386 aa  100  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.31256  normal  0.500943 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0899  transposase, IS605 OrfB family  24.71 
 
 		 363 aa  100  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000841843  hitchhiker  0.0000000725079 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0417  transposase, IS605 OrfB family  24.94 
 
 		 363 aa  100  7e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.413645  normal  0.0217582 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3168  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  27.06 
 
 		 381 aa  100  8e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1390  transposase  26.75 
 
 		 348 aa  100  8e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0279929  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5594  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  29.09 
 
 		 381 aa  100  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815398  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6840  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  32.76 
 
 		 396 aa  99.8  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.643066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3850  transposase, IS605 OrfB family  24.71 
 
 		 363 aa  99  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0104951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3554  transposase, IS605 OrfB family  24.71 
 
 		 363 aa  99  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3802  transposase, IS605 OrfB family  24.71 
 
 		 363 aa  99.8  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0668  transposase  31.28 
 
 		 231 aa  98.6  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000294639  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0079  IS605 family transposase OrfB  39.05 
 
 		 241 aa  98.2  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.523128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0717  transposase  31.28 
 
 		 219 aa  97.8  4e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0318714  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1280  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  38.38 
 
 		 403 aa  97.8  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  28.23 
 
 		 368 aa  97.4  5e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0127  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  37.84 
 
 		 403 aa  97.1  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.291596 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0122  transposase  27.59 
 
 		 402 aa  96.7  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3044  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  27.84 
 
 		 376 aa  96.7  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3509  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  36.55 
 
 		 398 aa  96.7  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4149  IS605 family transposase OrfB  25.66 
 
 		 367 aa  96.3  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.247919 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0457  transposase, IS605 OrfB family  24.47 
 
 		 363 aa  96.3  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.196449 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4039  IS605 family transposase OrfB  24.94 
 
 		 377 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1554  IS605 family transposase OrfB  27.71 
 
 		 377 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.596284 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0071  IS891/IS1136/IS1341 transposase  25 
 
 		 395 aa  95.5  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2012  transposase, IS605 OrfB family  25.65 
 
 		 362 aa  95.1  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.27721  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4154  transposase, IS605 OrfB family  25.91 
 
 		 383 aa  93.6  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2895  transposase, IS605 OrfB family  28.29 
 
 		 405 aa  93.2  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.56532  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4194  transposase, IS605 OrfB family  25.91 
 
 		 383 aa  93.2  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1376  transposase, IS605 OrfB family  27.4 
 
 		 391 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3489  transposase, IS605 OrfB family  27.31 
 
 		 409 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3220  transposase, IS605 OrfB family  25.3 
 
 		 404 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4184  IS605 family transposase OrfB  25.42 
 
 		 367 aa  92  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.90515  normal  0.53705 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>